RNA–Protein interactions for RNA: YMR014W

BUD22, Transcript of Protein required for rRNA maturation and ribosomal subunit biogenesis, yeast

Gene BUD22, Length 1,560 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BUD22	YMR014W	RCN1	P36054	211 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	MOH1	P38191	138 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	MDM31	P38880	579 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	ZRG8	P40021	1076 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	RTT105	P40063	208 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	FAU1	P40099	211 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	MRPS18	P42847	217 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	IDS2	P46958	469 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	AAD10	P47182	288 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	COQ5	P49017	307 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	NBP35	P52920	328 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	CPR8	P53728	308 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	YHM2	Q04013	314 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	YMR087W	Q04299	284 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	HAL9	Q12180	1030 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	YLR126C	Q12288	251 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	WHI5	Q12416	295 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	HIS5	P07172	385 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	YOL163W	P0CF20	169 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	YIM1	P28625	365 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	MKK1	P32490	508 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	OAR1	P35731	278 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	YBR063C	P38083	404 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	PCL6	P40038	420 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	LAS21	P40367	830 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	MET28	P40573	187 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	MAL11	P53048	616 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	YGR079W	P53249	370 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	SPC19	Q03954	165 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	RRN11	Q04712	507 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	RSF1	Q05043	376 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	YPS7	Q06325	596 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	ACF2	Q12168	779 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	YOR114W	Q12219	294 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	YOR214C	Q12282	236 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	APC2	Q12440	853 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	TAO3	P40468	2376 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	SEC12	P11655	471 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	CAP2	P13517	287 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	RPB5	P20434	215 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	BUB3	P26449	341 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	SRB5	P32585	307 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	BNA4	P38169	460 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	SBE22	P38814	852 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	NVJ1	P38881	321 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	YJL049W	P47048	450 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	MDE1	P47095	244 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	NUP57	P48837	541 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	COS10	P52924	374 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	MKC7	P53379	596 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	AQR1	P53943	586 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	RHO4	Q00246	291 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	TDA1	Q03533	586 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	RNH202	Q05635	350 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	MLC2	Q06580	163 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	YLR040C	Q07988	224 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	SGO1	Q08490	590 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	RTT10	Q08924	1013 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	UIP4	Q08926	304 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	SRO7	Q12038	1033 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	SCM3	Q12334	223 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	GPR1	Q12361	961 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	YPR064W	Q12492	139 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	QCR7	P00128	127 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	APN1	P22936	367 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	NTH1	P32356	751 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	SPT14	P32363	452 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	YPT7	P32939	208 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	SFC1	P33303	322 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	MTC2	P34246	357 aa		4.53	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 24.2 ms