RNA–Protein interactions for RNA: YKR047W

YKR047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKR047W, Length 306 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR047WYKR047W LCB3P47013 409 aa4.08□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W YJR030CP47101 745 aa4.08□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W EMC2P47133 292 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W TRF5P48561 642 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W TAF6P53040 516 aa4.08□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W RRN5Q02983 363 aa4.08□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W SMC5Q08204 1093 aa4.08□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W PPT2Q12036 173 aa4.08□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W PCL9Q12477 304 aa4.08□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W HTZ1Q12692 134 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W YCL021W-AQ96VH3 125 aa4.08□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W SSA3P09435 649 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W DEG1P31115 442 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W MKK1P32490 508 aa4.07□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W YKL162CP36052 402 aa4.07□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W ECM8P38246 354 aa4.07□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W YMR262WP38430 313 aa4.07□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W YPT35P38815 214 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W MAM33P40513 266 aa4.07□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W AIM24P47127 394 aa4.07□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W MTM1P53320 366 aa4.07□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W PXR1P53335 271 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W YNL050CP53952 270 aa4.07□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W YML122CQ03207 126 aa4.07□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W TDA1Q03533 586 aa4.07□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W CSM3Q04659 317 aa4.07□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W SAM4Q08985 325 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W DSE1P40077 573 aa4.06□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W INA22P40576 216 aa4.06□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W MTQ1P53944 314 aa4.06□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W CSI1Q04368 295 aa4.06□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W TSR1Q07381 788 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W RRT8Q08219 342 aa4.06□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W NAM2P11325 894 aa4.05□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W RBK1P25332 333 aa4.05□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W RPL5P26321 297 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W ERG9P29704 444 aa4.05□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W KAR9P32526 644 aa4.05□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W ECT1P33412 323 aa4.05□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W SDH3P33421 198 aa4.05□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W SMC2P38989 1170 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W HAC1P41546 238 aa4.05□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W YCH1P42937 148 aa4.05□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W CTK3P46963 296 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W SCS3P53012 380 aa4.05□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W MPP6P53725 186 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W YNL260CP53846 198 aa4.05□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W CWC25P53854 179 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W YMR010WQ03687 405 aa4.05□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W RRN11Q04712 507 aa4.05□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W YOR387CQ08910 206 aa4.05□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W SLF1Q12034 447 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W YGK3Q12222 375 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W FMP16Q12497 93 aa4.05□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W UBA3Q99344 299 aa4.05□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W RAD7P06779 565 aa4.04□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W GPI12P23797 304 aa4.04□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W DCC1P25559 380 aa4.04□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W POP5P28005 173 aa4.04□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W ICL1P28240 557 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W ACB1P31787 87 aa4.04□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W SPO23P33757 523 aa4.04□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W MMS21P38632 267 aa4.04□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W NDT80P38830 627 aa4.04□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W FHL1P39521 936 aa4.04□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W UBX2Q04228 584 aa4.04□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W YMR317WQ04893 1140 aa4.04□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W YPR091CQ06833 770 aa4.04□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W FCY22Q12119 530 aa4.04□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W LDB17Q12342 491 aa4.04□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W ICT1Q12385 394 aa4.04□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W YER078W-AQ3E7A2 54 aa4.04□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W CSM1P25651 190 aa4.03□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W AVT5P38176 459 aa4.03□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W RTN1Q04947 295 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W PBA1Q05778 276 aa4.03□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W BCP1Q06338 283 aa4.03□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W ALE1Q08548 619 aa4.03□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W TMS1Q12116 473 aa4.03□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W YBR298C-AQ8TGK4 73 aa4.03□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W RPL16AP26784 199 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W ITR2P30606 609 aa4.02□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W SPR1P32603 445 aa4.02□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W TMT1P32643 299 aa4.02□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W TPO5P36029 618 aa4.02□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W YKR015CP36111 568 aa4.02□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W PTH1P38876 190 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W YJR085CP47131 105 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W LSG1P53145 640 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W YLL007CQ07799 665 aa4.02□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W YPQ1Q12010 308 aa4.02□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W SIA1Q12212 622 aa4.02□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W TDH1P00360 332 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W HHF1P02309 103 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W MSI1P13712 422 aa4.01□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W DFG10P40526 253 aa4.01□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W CIN2P46670 268 aa4.01□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W COX16P47081 118 aa4.01□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W MST27P53176 234 aa4.01□□□□□ -1.77
YKR047WYKR047W YGR266WP53326 701 aa4.01□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 30.1 ms