RNA–Protein interactions for RNA: YKL169C

YKL169C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YKL169C, Length 384 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL169C	YKL169C	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	MDS3	P53094	1487 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	JIP3	O13555	125 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	GPI12	P23797	304 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	CSM1	P25651	190 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	PRR1	P28708	518 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	MSK1	P32048	576 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	YHR182W	P38870	785 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	SIM1	P40472	476 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	YJL118W	P47022	219 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	PHB2	P50085	310 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	MMT1	Q03218	510 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	BUR2	Q05949	395 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	YAP7	Q08182	245 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	TIM18	Q08749	192 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	YPR1	Q12458	312 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	YOS9	Q99220	542 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	SPT6	P23615	1451 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	HEM2	P05373	342 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	DST1	P07273	309 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	MSF1	P08425	469 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	CWP1	P28319	239 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	MMS21	P38632	267 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	FET3	P38993	636 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	SSN8	P47821	323 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	YDL186W	P48568	277 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	SPP2	Q02521	185 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	YML122C	Q03207	126 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	BET5	Q03630	159 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	RGS2	Q99188	309 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	YSR3	P23501	404 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	TOA2	P32774	122 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	YBR137W	P38276	179 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	RPH1	P39956	796 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	FMP33	P46998	180 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	STE24	P47154	453 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	TOS2	P50078	622 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	PIR3	Q03180	325 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	AIM33	Q04516	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	GET4	Q12125	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	FSH3	Q99369	266 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	RAD3	P06839	778 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	YPK2	P18961	677 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	YKL097C	P34245	136 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	DSE1	P40077	573 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	RET3	P53600	189 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	SLT2	Q00772	484 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	UBA3	Q99344	299 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	BUD4	P47136	1447 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	OPI3	P05375	206 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	RAD7	P06779	565 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	SKN1	P33336	771 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	MIX23	P38162	196 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	FAA2	P39518	744 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	MRX5	P47007	382 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	YGR168C	P53293	376 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	CAF40	P53829	373 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	MPS1	P54199	764 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	HXT11	P54862	567 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	YMR181C	Q03231	154 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	SMP3	Q04174	516 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	YOL075C	Q08234	1294 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	MUM3	Q08750	479 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	AFT2	Q08957	416 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	ATG31	Q12421	196 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	SET6	Q12529	373 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	CMC2	Q3E7A4	109 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKL169C	YKL169C	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YKL169C	YKL169C	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.52	□□□□□ -1.69	not detected
YKL169C	YKL169C	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YKL169C	YKL169C	CLN3	P13365	580 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKL169C	YKL169C	COQ1	P18900	473 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKL169C	YKL169C	PPA2	P28239	310 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKL169C	YKL169C	ZIP1	P31111	875 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKL169C	YKL169C	SBE22	P38814	852 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKL169C	YKL169C	HIT1	P46973	164 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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