RNA–Protein interactions for RNA: YHR004C

NEM1, Transcript of Probable catalytic subunit of Nem1p-Spo7p phosphatase holoenzyme, yeast

Gene NEM1, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NEM1	YHR004C	MRP51	Q02950	344 aa		3.44	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	GIP3	Q03016	1276 aa		3.44	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	SNZ1	Q03148	297 aa		3.44	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	BNA7	Q04066	261 aa		3.44	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	HSP31	Q04432	237 aa		3.44	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	3.44	□□□□□ -1.86	not detected
NEM1	YHR004C	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	RGS2	Q99188	309 aa		3.44	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	SUC2	P00724	532 aa		3.43	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	CHS1	P08004	1131 aa		3.43	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	MSK1	P32048	576 aa		3.43	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	BUD2	P33314	1104 aa		3.43	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	ECT1	P33412	323 aa		3.43	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	QDR3	P38227	689 aa		3.43	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	SCC4	P40090	624 aa		3.43	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	OTU1	P43558	301 aa		3.43	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	TOS3	P43637	560 aa		3.43	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	STD1	Q02794	444 aa		3.43	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	MSC1	Q03104	513 aa		3.43	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	MSF1	P08425	469 aa		3.42	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	ATP11	P32453	318 aa		3.42	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	MNS1	P32906	549 aa		3.42	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	MMS21	P38632	267 aa		3.42	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	STE24	P47154	453 aa		3.42	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	TIM21	P53220	239 aa		3.42	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	IBD2	P53892	351 aa		3.42	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	RSN1	Q03516	953 aa		3.42	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	REX4	Q08237	289 aa		3.42	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	GIS3	Q12418	502 aa		3.42	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	YPR1	Q12458	312 aa		3.42	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	RAD3	P06839	778 aa		3.41	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	PRB1	P09232	635 aa		3.41	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	YSR3	P23501	404 aa		3.41	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	PCL1	P24867	279 aa		3.41	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	RAD57	P25301	460 aa		3.41	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	DAL2	P25335	343 aa		3.41	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	CSM1	P25651	190 aa		3.41	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	CIN8	P27895	1000 aa		3.41	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	PPA2	P28239	310 aa		3.41	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	RSM22	P36056	628 aa		3.41	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	AIM29	P36154	155 aa		3.41	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	GPI16	P38875	610 aa		3.41	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	YMR134W	P40207	237 aa		3.41	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	YPS6	P40583	537 aa		3.41	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	PHO86	P46956	311 aa		3.41	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	KAP114	P53067	1004 aa		3.41	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	RET3	P53600	189 aa		3.41	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	TAF12	Q03761	539 aa		3.41	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	YLR283W	Q05867	314 aa		3.41	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	MDM30	Q05930	598 aa		3.41	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	BUR2	Q05949	395 aa		3.41	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	GMC2	Q06201	188 aa		3.41	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	SOR2	Q07786	357 aa		3.41	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	YOR012W	Q12351	137 aa		3.41	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	FSH3	Q99369	266 aa		3.41	□□□□□ -1.86
NEM1	YHR004C	COX3	P00420	269 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NEM1	YHR004C	DST1	P07273	309 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NEM1	YHR004C	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
NEM1	YHR004C	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
NEM1	YHR004C	MAS2	P11914	482 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NEM1	YHR004C	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
NEM1	YHR004C	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
NEM1	YHR004C	ZIP1	P31111	875 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NEM1	YHR004C	DOA1	P36037	715 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NEM1	YHR004C	MAL32	P38158	584 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NEM1	YHR004C	TDA11	P38854	504 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NEM1	YHR004C	SAS2	P40963	338 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NEM1	YHR004C	MAL12	P53341	584 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NEM1	YHR004C	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
NEM1	YHR004C	MMT1	Q03218	510 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NEM1	YHR004C	TSA2	Q04120	196 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NEM1	YHR004C	SIA1	Q12212	622 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NEM1	YHR004C	SEY1	Q99287	776 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NEM1	YHR004C	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
NEM1	YHR004C	SEC63	P14906	663 aa		3.39	□□□□□ -1.87
NEM1	YHR004C	COQ1	P18900	473 aa		3.39	□□□□□ -1.87
NEM1	YHR004C	DAL82	P21705	255 aa		3.39	□□□□□ -1.87
NEM1	YHR004C	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
NEM1	YHR004C	COX16	P47081	118 aa		3.39	□□□□□ -1.87
NEM1	YHR004C	YGR117C	P53270	476 aa		3.39	□□□□□ -1.87

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