RNA–Protein interactions for RNA: YGR014W

MSB2, Transcript of Mucin family member involved in various signaling pathways, yeast

Gene MSB2, Length 3,921 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSB2	YGR014W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	2.62	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	NRM1	P53718	249 aa		2.62	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	MTQ1	P53944	314 aa		2.62	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	OPT2	Q06593	877 aa		2.62	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	STE7	P06784	515 aa		2.62	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	HOM3	P10869	527 aa		2.62	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	NPR1	P22211	790 aa		2.62	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	MCM7	P38132	845 aa		2.62	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	STS1	P38637	319 aa		2.62	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	FAR7	P43592	221 aa		2.62	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	2.62	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	YOL036W	Q08206	761 aa		2.62	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	NKP1	Q12493	238 aa		2.62	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	LSO1	Q3E827	93 aa		2.62	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	PET122	P10355	254 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	RPS27B	P38711	82 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	YHR219W	P38900	624 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	AZF1	P41696	914 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	TPC1	P53257	314 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	MTM1	P53320	366 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	GSH2	Q08220	491 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	YRM1	Q12340	786 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	YPR1	Q12458	312 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	YOR343C	Q12484	108 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	MHF1	Q3E835	90 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	ADH7	P25377	361 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	VNX1	P42839	908 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	SPT20	P50875	604 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	MEP3	P53390	489 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	GIS1	Q03833	894 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	YML096W	Q04489	525 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	PDR8	Q06149	701 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	ATG17	Q06410	417 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	CYK3	Q07533	885 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	COQ10	Q08058	207 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	FRE5	Q08908	694 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	ATG41	Q12048	136 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	ERD1	P16151	362 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	DOA4	P32571	926 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	GEP4	P38812	185 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	APE4	P38821	490 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.61	□□□□□ -1.99	not detected
MSB2	YGR014W	UME6	P39001	836 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	PAC10	P48363	199 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	YDR391C	Q04170	232 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	VTA1	Q06263	330 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	TFB4	Q12004	338 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	ULA1	Q12059	462 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	MCP1	Q12106	302 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	SFC1	P33303	322 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	ECM4	P36156	370 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	YKE4	P40544	346 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	TYW3	P53177	273 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	YGR016W	P53209	190 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	BUD9	P53226	547 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	RSC9	Q03124	581 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	MRX10	Q05648	414 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	PET54	P10834	293 aa		2.6	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	CPR4	P25334	318 aa		2.6	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	PEX4	P29340	183 aa		2.6	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	SHU2	P38957	223 aa		2.6	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	BUR6	P40096	142 aa		2.6	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	PEX12	Q04370	399 aa		2.6	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	SYO1	Q07395	620 aa		2.6	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	SGT1	Q08446	395 aa		2.6	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	YPR011C	Q12251	326 aa		2.6	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	GLE1	Q12315	538 aa		2.6	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	GPR1	Q12361	961 aa		2.6	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	YPR064W	Q12492	139 aa		2.6	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	APN1	P22936	367 aa		2.6	□□□□□ -1.99
MSB2	YGR014W	PEX3	P28795	441 aa		2.6	□□□□□ -1.99

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 33.8 ms