RNA–Protein interactions for RNA: YPL207W

TYW1, Iron-sulfer protein required for synthesis of Wybutosine modified tRNA, yeast

Gene TYW1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TYW1	YPL207W	MMT1	Q03218	510 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	ARO10	Q06408	635 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	USV1	Q12132	391 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	MSH5	Q12175	901 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	CLN3	P13365	580 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	SPT10	P35208	640 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	HIS2	P38635	335 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	PCL6	P40038	420 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	STB4	P50104	949 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	SPT20	P50875	604 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	RIM8	P53179	542 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	COG2	P53271	262 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	MTQ1	P53944	314 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	HSP31	Q04432	237 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	GMC2	Q06201	188 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	NCB2	Q92317	146 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	RPO26	P20435	155 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	SKT5	P34226	696 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	SLM1	P40485	686 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	MRX5	P47007	382 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	LIF1	P53150	421 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	SLI1	P53304	468 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	YPR003C	P53394	754 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	BIO4	P53630	237 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	YPL068C	Q02749	293 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	TRS23	Q03784	219 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	YPR1	Q12458	312 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	MXR2	P25566	168 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	REC114	P32841	428 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	YJL163C	P46996	555 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	YGR035C	P53222	116 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	YTP1	P53584	459 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	UBX2	Q04228	584 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	DCR2	Q05924	578 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	GRE1	Q08969	168 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	SUT2	Q12286	268 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	PSK1	P31374	1356 aa		4.15	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	IMA3	P0CW40	589 aa		4.15	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	IMA4	P0CW41	589 aa		4.15	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	RAD24	P32641	659 aa		4.15	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	APL3	P38065	1025 aa		4.15	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	TOS2	P50078	622 aa		4.15	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	YGR168C	P53293	376 aa		4.15	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	CDD1	Q06549	142 aa		4.15	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	YOL075C	Q08234	1294 aa		4.15	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	IMA2	Q08295	589 aa		4.15	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	YDL177C	Q12257	170 aa		4.15	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	FRE7	Q12333	620 aa		4.15	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		4.15	□□□□□ -1.74
TYW1	YPL207W	RAD7	P06779	565 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TYW1	YPL207W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
TYW1	YPL207W	YAK1	P14680	807 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TYW1	YPL207W	YSR3	P23501	404 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TYW1	YPL207W	CLB2	P24869	491 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TYW1	YPL207W	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
TYW1	YPL207W	TAF14	P35189	244 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TYW1	YPL207W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
TYW1	YPL207W	RSM22	P36056	628 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TYW1	YPL207W	SUR2	P38992	349 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TYW1	YPL207W	CDC1	P40986	491 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TYW1	YPL207W	BUL1	P48524	976 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TYW1	YPL207W	GIP3	Q03016	1276 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TYW1	YPL207W	SMP3	Q04174	516 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TYW1	YPL207W	DLT1	Q04216	342 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TYW1	YPL207W	SIA1	Q12212	622 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TYW1	YPL207W	YLR108C	Q12259	485 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TYW1	YPL207W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
TYW1	YPL207W	MAS2	P11914	482 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TYW1	YPL207W	TYR1	P20049	452 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TYW1	YPL207W	UTR1	P21373	530 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TYW1	YPL207W	RAD57	P25301	460 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TYW1	YPL207W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
TYW1	YPL207W	FMP52	P40008	231 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TYW1	YPL207W	ERG28	P40030	148 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TYW1	YPL207W	COA1	P40452	197 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TYW1	YPL207W	YIR016W	P40572	265 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TYW1	YPL207W	MPS1	P54199	764 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TYW1	YPL207W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
TYW1	YPL207W	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
TYW1	YPL207W	GAL4	P04386	881 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TYW1	YPL207W	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
TYW1	YPL207W	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
TYW1	YPL207W	DAL82	P21705	255 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TYW1	YPL207W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
TYW1	YPL207W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
TYW1	YPL207W	TRS85	P46944	698 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TYW1	YPL207W	PRY1	P47032	299 aa		4.14	□□□□□ -1.75

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