RNA–Protein interactions for RNA: YMR014W

BUD22, Transcript of Protein required for rRNA maturation and ribosomal subunit biogenesis, yeast

Gene BUD22, Length 1,560 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BUD22	YMR014W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	YBR139W	P38109	508 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	YHR177W	P38867	453 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	RRG9	P40156	214 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	SER33	P40510	469 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	SNM1	P40993	198 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	ALR2	P43553	858 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	CHA4	P43634	648 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	EXG2	P52911	562 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	SFB2	P53953	876 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	ENA2	Q01896	1091 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	RIM13	Q03792	727 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	MGR3	Q04472	501 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	YLR036C	Q07986	203 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	RCN2	Q12044	265 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	ENA5	Q12691	1091 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	GCN3	P14741	305 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	ARE1	P25628	610 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	ADE1	P27616	306 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
BUD22	YMR014W	MNN2	P38069	597 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	RRN10	P38204	145 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	SOK1	P40317	901 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	PRM10	P42946	383 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	HOC1	P47124	396 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	ROG1	P53118	685 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	HXT15	P54854	567 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	NUP49	Q02199	472 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	ABZ2	Q03266	374 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	YEH1	Q07804	573 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	NFI1	Q12216	726 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	RBD2	Q12270	262 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	AHC1	Q12433	566 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	MEI5	P32489	222 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	CBP4	P37267	147 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	YHR033W	P38690	423 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	BIG1	P38813	335 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	SSU1	P41930	458 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	YFR020W	P43600	232 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	IRC7	P43623	340 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	SSY5	P47002	699 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	SNF12	P53628	566 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	ROY1	Q04847	553 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	PEX10	Q05568	337 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	EAF1	Q06337	982 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	GSH2	Q08220	491 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	REX4	Q08237	289 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	RPN13	O13563	156 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	COX3	P00420	269 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	ALG7	P07286	448 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	NFT1	P0CE68	1218 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	GPX2	P38143	162 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	MBA1	P38300	278 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	TAE1	P38340	232 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	MED6	P38782	295 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	CTF8	P38877	133 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	GDH3	P39708	457 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	RAD17	P48581	401 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	BIO3	P50277	480 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	RTS3	P53289	263 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	AAT1	Q01802	451 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	YPL113C	Q02961	396 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	KRE28	Q04431	385 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	PDR8	Q06149	701 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	SWA2	Q06677	668 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	ATG10	Q07879	167 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	OPI10	Q08202	246 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	SIA1	Q12212	622 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	RKM5	Q12367	367 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	SFG1	Q12507	346 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	HIP1	P06775	603 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	PTC6	P25646	442 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	OAC1	P32332	324 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	SUR1	P33300	382 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BUD22	YMR014W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68

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