RNA–Protein interactions for RNA: YKL103C

APE1, Transcript of Vacuolar aminopeptidase yscI, yeast

Gene APE1, Length 1,545 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
APE1	YKL103C	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	CKI1	P20485	582 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	RAD57	P25301	460 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	MSN2	P33748	704 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	DSN1	P40568	576 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	SAD1	P43589	448 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	RIM8	P53179	542 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	YPL068C	Q02749	293 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	TLG2	Q08144	397 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	RRI1	Q12468	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	NCB2	Q92317	146 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	MHP1	P43638	1398 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	CBF1	P17106	351 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	STE18	P18852	110 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	MRPL9	P31334	269 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	YKL162C	P36052	402 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	CBP4	P37267	147 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	RIB1	P38066	345 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	YPK3	P38070	525 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	FMP52	P40008	231 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	YGR067C	P53243	804 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	SNO2	P53823	222 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	MPS1	P54199	764 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	FMP30	Q02883	468 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	SMP3	Q04174	516 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	UBX2	Q04228	584 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	YDR222W	Q04925	415 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	ENB1	Q08299	606 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	MCA1	Q08601	432 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	YOR365C	Q08844	703 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	TIP41	Q12199	356 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	NUP192	P47054	1683 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	WHI2	P12611	486 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	CLN3	P13365	580 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	SYG1	P40528	902 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	YIL001W	P40560	513 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	YJL163C	P46996	555 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	PRY1	P47032	299 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	COX16	P47081	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	UBP8	P50102	471 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	PMT5	P52867	743 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	SAM50	P53969	484 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	GIP3	Q03016	1276 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	YPL034W	Q03083	165 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	KRE28	Q04431	385 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	HRD3	Q05787	833 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	YLR224W	Q05947	369 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	SPO77	Q06134	477 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	MSH5	Q12175	901 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	GAL4	P04386	881 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	MAS2	P11914	482 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	TYR1	P20049	452 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	UTR1	P21373	530 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	MXR2	P25566	168 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	PEX3	P28795	441 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	COQ2	P32378	372 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	RAD24	P32641	659 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	LIP5	P32875	414 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	MIA40	P36046	403 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	TAF6	P53040	516 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	NUP116	Q02630	1113 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	VPS74	Q06385	345 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	CDD1	Q06549	142 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	YLR049C	Q12110	428 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	SUT2	Q12286	268 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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