RNA–Protein interactions for RNA: YHR015W

MIP6, Transcript of Putative RNA-binding protein, yeast

Gene MIP6, Length 1,980 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MIP6	YHR015W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.13	□□□□□ -1.91	not detected
MIP6	YHR015W	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	CSM1	P25651	190 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	COX13	P32799	129 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	PET100	P38958	111 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	SLM1	P40485	686 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	AVT4	P50944	713 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	YNL181W	P53878	407 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	ODC1	Q03028	310 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	RRN11	Q04712	507 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	CTS2	Q06350	511 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	YPR172W	Q06608	200 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	SGT1	Q08446	395 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	YRM1	Q12340	786 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	NCA2	Q12374	616 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	GIS3	Q12418	502 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	YPR1	Q12458	312 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	BNR1	P40450	1375 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	SAC3	P46674	1301 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	QCR6	P00127	147 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	MSF1	P08425	469 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	GPX2	P38143	162 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	HAT2	P39984	401 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	SHO1	P40073	367 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	RAD17	P48581	401 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	YGR117C	P53270	476 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	PET117	Q02771	107 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	YOL075C	Q08234	1294 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	BSC6	Q08280	497 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	YOP1	Q12402	180 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	AHC1	Q12433	566 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	RGS2	Q99188	309 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	UBA3	Q99344	299 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	SNQ2	P32568	1501 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	TRM732	Q03496	1420 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	EXO70	P19658	623 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	CWP1	P28319	239 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	SKT5	P34226	696 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	RSM22	P36056	628 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	IST2	P38250	946 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	CFD1	P40558	293 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	INA22	P40576	216 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	AZF1	P41696	914 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	YCH1	P42937	148 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	BNA6	P43619	295 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	SPR6	Q01684	191 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	SPP2	Q02521	185 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	BCP1	Q06338	283 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	TIM18	Q08749	192 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	CRC1	Q12289	327 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	STH1	P32597	1359 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	SUA5	P32579	426 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	PPZ2	P33329	710 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	COS9	P36034	407 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	YBR137W	P38276	179 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	SNO3	P43544	222 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	SSN8	P47821	323 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	AZR1	P50080	613 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	LST7	P53237	242 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	BIO4	P53630	237 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	BET4	Q00618	327 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	SRL4	Q03085	281 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	ECI1	Q05871	280 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	COX2	P00410	251 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	CAP2	P13517	287 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	MRPL25	P23369	157 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	RAD51	P25454	400 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.11	□□□□□ -1.91	not detected
MIP6	YHR015W	SCO2	P38072	301 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	DTR1	P38125	572 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	PRM9	P39551	298 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	YER085C	P40058	173 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	SEC9	P40357	651 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MIP6	YHR015W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91

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