RNA–Protein interactions for RNA: YPL253C

VIK1, Transcript of Protein that forms a kinesin-14 heterodimeric motor with Kar3p, yeast

Gene VIK1, Length 1,944 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	YPL253C	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	YGL138C	P53122	345 aa		0.95	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	YPR096C	O13587	100 aa		0.94	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	0.94	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	SRB2	P34162	210 aa		0.94	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	TRR2	P38816	342 aa		0.94	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	KEG1	P43614	200 aa		0.94	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	VEL1	P53058	206 aa		0.94	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	0.94	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	ZIP1	P31111	875 aa		0.93	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	TOA1	P32773	286 aa		0.93	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	FRM2	P37261	193 aa		0.93	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	WSC4	P38739	605 aa		0.93	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	YDR115W	Q04598	105 aa		0.93	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	FAR10	Q06001	478 aa		0.93	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	DDC1	Q08949	612 aa		0.93	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	POM152	P39685	1337 aa		0.93	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	MET17	P06106	444 aa		0.93	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	ROX1	P25042	368 aa		0.93	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	HEL1	P36113	551 aa		0.93	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	COS4	P43542	379 aa		0.93	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	SKO1	Q02100	647 aa		0.93	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	ECM7	Q06200	448 aa		0.93	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	YLR177W	Q06251	628 aa		0.93	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	COX3	P00420	269 aa		0.92	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.92	□□□□□ -2.26	not detected
VIK1	YPL253C	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	ALG1	P16661	449 aa		0.92	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	ECM8	P38246	354 aa		0.92	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	MSC3	Q05812	728 aa		0.92	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		0.92	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	AUS1	Q08409	1394 aa		0.92	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	CKA1	P15790	372 aa		0.91	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	UTR5	P32630	166 aa		0.91	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	SAS3	P34218	831 aa		0.91	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	YGR117C	P53270	476 aa		0.91	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	VAC7	P53950	1165 aa		0.91	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	SPR6	Q01684	191 aa		0.91	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	KAP120	Q02932	1032 aa		0.91	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	INP2	Q03824	705 aa		0.91	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	MRX8	Q05473	314 aa		0.91	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	YOR376W	Q08900	122 aa		0.91	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	LDB17	Q12342	491 aa		0.91	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	EPT1	P22140	391 aa		0.91	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	SPO23	P33757	523 aa		0.91	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	IRC6	P43615	237 aa		0.91	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	RTS3	P53289	263 aa		0.91	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	SRO7	Q12038	1033 aa		0.91	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	SFM1	Q12314	213 aa		0.91	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
VIK1	YPL253C	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.27
VIK1	YPL253C	GPX2	P38143	162 aa		0.9	□□□□□ -2.27
VIK1	YPL253C	GPI16	P38875	610 aa		0.9	□□□□□ -2.27
VIK1	YPL253C	HEM14	P40012	539 aa		0.9	□□□□□ -2.27
VIK1	YPL253C	RRT13	P40042	185 aa		0.9	□□□□□ -2.27
VIK1	YPL253C	OCA2	P53949	197 aa		0.9	□□□□□ -2.27
VIK1	YPL253C	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
VIK1	YPL253C	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
VIK1	YPL253C	HIF1	Q12373	385 aa		0.9	□□□□□ -2.27
VIK1	YPL253C	PCL9	Q12477	304 aa		0.9	□□□□□ -2.27
VIK1	YPL253C	CLB3	P24870	427 aa		0.89	□□□□□ -2.27
VIK1	YPL253C	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
VIK1	YPL253C	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
VIK1	YPL253C	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
VIK1	YPL253C	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
VIK1	YPL253C	YIL059C	P40520	121 aa		0.89	□□□□□ -2.27
VIK1	YPL253C	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
VIK1	YPL253C	RMI1	Q02685	241 aa		0.89	□□□□□ -2.27
VIK1	YPL253C	DCS1	Q06151	350 aa		0.89	□□□□□ -2.27
VIK1	YPL253C	URA4	P20051	364 aa		0.89	□□□□□ -2.27
VIK1	YPL253C	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
VIK1	YPL253C	BRF1	P29056	596 aa		0.89	□□□□□ -2.27
VIK1	YPL253C	SKT5	P34226	696 aa		0.89	□□□□□ -2.27
VIK1	YPL253C	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
VIK1	YPL253C	SDH4	P37298	181 aa		0.89	□□□□□ -2.27
VIK1	YPL253C	SCC4	P40090	624 aa		0.89	□□□□□ -2.27
VIK1	YPL253C	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
VIK1	YPL253C	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
VIK1	YPL253C	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
VIK1	YPL253C	YMR130W	Q04223	302 aa		0.89	□□□□□ -2.27
VIK1	YPL253C	HMS1	Q12398	434 aa		0.89	□□□□□ -2.27
VIK1	YPL253C	RTN2	Q12443	393 aa		0.89	□□□□□ -2.27
VIK1	YPL253C	DST1	P07273	309 aa		0.88	□□□□□ -2.27
VIK1	YPL253C	DAL5	P15365	543 aa		0.88	□□□□□ -2.27
VIK1	YPL253C	CKA2	P19454	339 aa		0.88	□□□□□ -2.27
VIK1	YPL253C	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
VIK1	YPL253C	ANP1	P32629	500 aa		0.88	□□□□□ -2.27
VIK1	YPL253C	PPQ1	P32945	549 aa		0.88	□□□□□ -2.27

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