RNA–Protein interactions for RNA: YOR115C

TRS33, Transcript of Core component of transport protein particle (TRAPP) complexes I-III, yeast

Gene TRS33, Length 807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRS33	YOR115C	PUG1	P40100	303 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	BAP3	P41815	604 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	PMT4	P46971	762 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	YDL183C	P48569	320 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	MRPL22	P53881	309 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	YPL014W	Q02606	381 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	SWP1	Q02795	286 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	SRL4	Q03085	281 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	SEG1	Q04279	960 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	YLR224W	Q05947	369 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	YDL114W	Q07530	308 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	FMP45	Q07651	309 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	MFG1	Q07684	458 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	THP1	Q08231	455 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	YPL191C	Q08930	360 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	PER33	Q12144	273 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	SRN2	Q99176	213 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	MED11	Q99278	115 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	UBR1	P19812	1950 aa		4.65	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	URA3	P03962	267 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	STE3	P06783	470 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	CLB3	P24870	427 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	RHB1	P25378	209 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	PEX34	P25584	144 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	GSH1	P32477	678 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	MRPL6	P32904	214 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	YCR087C-A	P37263	153 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	YPK3	P38070	525 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	UBA4	P38820	440 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	YEL073C	P39974	107 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	COG3	P40094	801 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	YNL195C	P40168	261 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	MEP1	P40260	492 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	SWP82	P43554	623 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	EFM3	P47163	339 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	SNF12	P53628	566 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	PRM1	P53835	661 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	YNL260C	P53846	198 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	IRC15	Q02733	499 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	NRG1	Q03125	231 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	ENT2	Q05785	613 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	RXT3	Q07458	294 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	SGO1	Q08490	590 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	BUD7	Q08754	746 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	YDR056C	Q12025	205 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	YPR011C	Q12251	326 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	RGT2	Q12300	763 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	GLE1	Q12315	538 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	YDL199C	Q12407	687 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	LAS17	Q12446	633 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	MHF1	Q3E835	90 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	YOR338W	Q99326	363 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	RPN13	O13563	156 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	GAL3	P13045	520 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	RSR1	P13856	272 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	MET8	P15807	274 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	GRR1	P24814	1151 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	GLG1	P36143	616 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	SRL3	P36167	246 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	CBP4	P37267	147 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	ARA1	P38115	344 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	YHR033W	P38690	423 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	RPP1	P38786	293 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	PLB1	P39105	664 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	RPH1	P39956	796 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	HEM14	P40012	539 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	MPM1	P40364	252 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	MNT3	P40549	630 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	AZF1	P41696	914 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	FAR7	P43592	221 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	GLG2	P47011	380 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	AIM22	P47051	409 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	MUP1	P50276	574 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	SWC4	P53201	476 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	YGR015C	P53208	328 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	YPL107W	Q02873	248 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	ENB1	Q08299	606 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 26.6 ms