RNA–Protein interactions for RNA: YLR224W

YLR224W, Transcript of F-box protein and component of SCF ubiquitin ligase complexes, yeast

Gene YLR224W, Length 1,110 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR224W	YLR224W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	2.45	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	NUP2	P32499	720 aa		2.45	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	YEF1	P32622	495 aa		2.45	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	COX13	P32799	129 aa		2.45	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	SKN1	P33336	771 aa		2.45	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	STP2	P38704	541 aa		2.45	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	MEP1	P40260	492 aa		2.45	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	MAM33	P40513	266 aa		2.45	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	LCB3	P47013	409 aa		2.45	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	YMR102C	Q03177	834 aa		2.45	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	PRM6	Q04705	352 aa		2.45	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	2.45	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	NSE1	Q07913	336 aa		2.45	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	SMC5	Q08204	1093 aa		2.45	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	BSC6	Q08280	497 aa		2.45	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	2.45	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	EAF3	Q12432	401 aa		2.45	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	NUM1	Q00402	2748 aa		2.45	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	POM152	P39685	1337 aa		2.44	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	2.44	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	ALG1	P16661	449 aa		2.44	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	PHO91	P27514	894 aa		2.44	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	PRR1	P28708	518 aa		2.44	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.44	□□□□□ -2.02	not detected
YLR224W	YLR224W	SKT5	P34226	696 aa		2.44	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	YKL097C	P34245	136 aa		2.44	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	RTC2	P38279	296 aa		2.44	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	GPI16	P38875	610 aa		2.44	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	YFR057W	P43625	151 aa		2.44	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	AIM24	P47127	394 aa		2.44	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	BIR1	P47134	954 aa		2.44	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	GPI8	P49018	411 aa		2.44	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	MST27	P53176	234 aa		2.44	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	RSC1	P53236	928 aa		2.44	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	YGR117C	P53270	476 aa		2.44	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	HAL1	Q01766	294 aa		2.44	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	2.44	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	GYL1	Q04322	720 aa		2.44	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	2.44	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	AHC1	Q12433	566 aa		2.44	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	SPT7	P35177	1332 aa		2.43	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	2.43	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.43	□□□□□ -2.02	RIP-Chip
YLR224W	YLR224W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	2.43	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	2.43	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	PCL1	P24867	279 aa		2.43	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	2.43	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	2.43	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	YHK8	P38776	514 aa		2.43	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	PES4	P39684	611 aa		2.43	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	MIG3	P39943	394 aa		2.43	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	DFG10	P40526	253 aa		2.43	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	HAC1	P41546	238 aa		2.43	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	YJL055W	P47044	245 aa		2.43	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	2.43	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	ROG1	P53118	685 aa		2.43	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	VPS9	P54787	451 aa		2.43	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	YDR541C	Q03049	344 aa		2.43	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	TSA2	Q04120	196 aa		2.43	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	VTI1	Q04338	217 aa		2.43	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	NDL1	Q06568	189 aa		2.43	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	CAB3	P36076	571 aa		2.42	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	QDR3	P38227	689 aa		2.42	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	RXT2	P38255	430 aa		2.42	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	PAC11	P40960	533 aa		2.42	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	LCB2	P40970	561 aa		2.42	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	EGT2	P42835	1041 aa		2.42	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	STE24	P47154	453 aa		2.42	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	COS1	P53822	381 aa		2.42	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	SPR6	Q01684	191 aa		2.42	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	TDA1	Q03533	586 aa		2.42	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	2.42	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	2.42	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	RNH203	Q12338	110 aa		2.42	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	2.42	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		2.42	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	2.41	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	RPL12B	P0CX54	165 aa		2.41	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.41	□□□□□ -2.02	not detected
YLR224W	YLR224W	ANP1	P32629	500 aa		2.41	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	YSC83	P32792	385 aa		2.41	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	2.41	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	PEX5	P35056	612 aa		2.41	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	SPT10	P35208	640 aa		2.41	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	UTH1	P36135	365 aa		2.41	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	APE4	P38821	490 aa		2.41	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	POP2	P39008	433 aa		2.41	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	2.41	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	OXA1	P39952	402 aa		2.41	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	ATM1	P40416	690 aa		2.41	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	ATG18	P43601	500 aa		2.41	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	BNS1	P50084	137 aa		2.41	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	CLD1	P53264	445 aa		2.41	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	YOP1	Q12402	180 aa		2.41	□□□□□ -2.02
YLR224W	YLR224W	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	2.4	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	TPK3	P05986	398 aa		2.4	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	2.4	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	2.4	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	2.4	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	2.4	□□□□□ -2.03

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15 ms