RNA–Protein interactions for RNA: YPL060C-A

YPL060C-A, Transcript of TyA Gag protein, yeastyeast

Gene YPL060C-A, Length 3,315 nt, Biotype pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL060C-AYPL060C-A RKR1Q04781 1562 aa0.13□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A TPK3P05986 398 aa0.13□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A YCL068CP25593 260 aa0.13□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A GEP4P38812 185 aa0.13□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A ACA1P39970 489 aa0.13□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A EGT2P42835 1041 aa0.13□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A RPS10AQ08745 105 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A SLF1Q12034 447 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A RLM1Q12224 676 aa0.13□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A ATP1P07251 545 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A TCD2P36101 447 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A NUP133P36161 1157 aa0.13□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A APE3P37302 537 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A ATM1P40416 690 aa0.13□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A DLD2P46681 530 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A DUO1P53168 247 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A YJR112W-AQ3E743 109 aa0.13□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A NUP157P40064 1391 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A YCK1P23291 538 aa0.12□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A YSP3P25036 478 aa0.12□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A YEF1P32622 495 aa0.12□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A MUM2P38236 366 aa0.12□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A OM14P38325 134 aa0.12□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A YIL054WP40524 105 aa0.12□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A HXT14P42833 540 aa0.12□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A YGR021WP53212 290 aa0.12□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A ATG16Q03818 150 aa0.12□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A DNL4Q08387 944 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A RAD61Q99359 647 aa0.12□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A GCN4P03069 281 aa0.12□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A RRT12P25381 491 aa0.12□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A PUP3P25451 205 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A BEM1P29366 551 aa0.12□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A CHS3P29465 1165 aa0.12□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A DEP1P31385 405 aa0.12□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A SSH4P32343 579 aa0.12□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A RCK2P38623 610 aa0.12□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A RRT13P40042 185 aa0.12□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A YER188WP40103 239 aa0.12□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A SYG1P40528 902 aa0.12□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A RPN11P43588 306 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A PIL1P53252 339 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A RRB1Q04225 511 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A YPT1P01123 206 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A ADE4P04046 510 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A CBP6P07253 162 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A CLB3P24870 427 aa0.12□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A MFT1P33441 392 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A MST28P39552 234 aa0.12□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A DPH1P40487 425 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A ARC1P46672 376 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A ASA1Q06822 443 aa0.12□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A ATG9Q12142 997 aa0.12□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A YRF1-4O13559 1382 aa0.11□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A LDS1P31379 325 aa0.11□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A YPS1P32329 569 aa0.11□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A PEX5P35056 612 aa0.11□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A MIX23P38162 196 aa0.11□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A YHL041WP38730 149 aa0.11□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A AAD10P47182 288 aa0.11□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A PYK2P52489 506 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A YGL118CP53132 145 aa0.11□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A MMT1Q03218 510 aa0.11□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A HSP31Q04432 237 aa0.11□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A IES3Q12345 250 aa0.11□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A INH1P01097 85 aa0.11□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A ATP10P18496 279 aa0.11□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A SPB1P25582 841 aaPredicted RBP0.11□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A SPS19P32573 292 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A YMR244WQ04018 355 aa0.11□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A VPS15P22219 1454 aa0.11□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A IMA3P0CW40 589 aa0.1□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A IMA4P0CW41 589 aa0.1□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A SNF6P18888 332 aa0.1□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A RAD57P25301 460 aa0.1□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A PES4P39684 611 aa0.1□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A HCH1P53834 153 aa0.1□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A INP2Q03824 705 aa0.1□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A BCH1Q05029 724 aa0.1□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A RDS3Q06835 107 aaPredicted RBP0.1□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A IMA2Q08295 589 aa0.1□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A RPS8AP0CX39 200 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A RPS8BP0CX40 200 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A SKT5P34226 696 aa0.1□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A VTC1P40046 129 aaRIP-Chip data0.1□□□□□ -2.39not detected
YPL060C-AYPL060C-A SNL1P40548 159 aa0.1□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A BRO1P48582 844 aa0.1□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A MST27P53176 234 aa0.1□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A STD1Q02794 444 aa0.1□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A YMR181CQ03231 154 aa0.1□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A YMR130WQ04223 302 aa0.1□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A COQ9Q05779 260 aa0.1□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A YDR061WQ12298 539 aa0.1□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A YCR024C-BQ3E7Z8 88 aa0.1□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A RRP5Q05022 1729 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A GCN2P15442 1659 aa0.1□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A RRN10P38204 145 aa0.1□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A AIM22P47051 409 aa0.1□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A SHE4P51534 789 aa0.1□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A SNU66Q12420 587 aaPredicted RBP0.1□□□□□ -2.39
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