RNA–Protein interactions for RNA: YOR115C

TRS33, Transcript of Core component of transport protein particle (TRAPP) complexes I-III, yeast

Gene TRS33, Length 807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRS33	YOR115C	YNL095C	P53932	642 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	TOF2	Q02208	771 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	PEX12	Q04370	399 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	YDR124W	Q04608	324 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	IRC10	Q08118	586 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	UAF30	Q08747	228 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	NDD1	Q08887	554 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	YLR046C	Q12253	270 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	PHO5	P00635	467 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	CMK2	P22517	447 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	DMC1	P25453	334 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	GEX1	P25596	615 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	BRF1	P29056	596 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	CDC5	P32562	705 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	SGE1	P33335	543 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	SPC34	P36131	295 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	GEX2	P36173	615 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	FTH1	P38310	465 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	YHR112C	P38716	378 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	YLF2	P38746	405 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	TIM17	P39515	158 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	RBG1	P39729	369 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	GCD10	P41814	478 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	GAT1	P43574	510 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	GTO1	P48239	356 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	DSL1	P53847	754 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	IPI3	P53877	555 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	SED5	Q01590	340 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	PIR1	Q03178	341 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	YDR239C	Q03780	787 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	VTA1	Q06263	330 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	RAD34	Q06665	692 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	SWA2	Q06677	668 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.71	□□□□□ -1.66	not detected
TRS33	YOR115C	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	VIK1	Q12045	647 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	MLH3	Q12083	715 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	MSH5	Q12175	901 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	IES3	Q12345	250 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	RPN6	Q12377	434 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	SNF8	Q12483	233 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	YLR422W	Q06409	1932 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	RAD7	P06779	565 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	MSF1	P08425	469 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	RAP1	P11938	827 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	FAR1	P21268	830 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	DAL81	P21657	970 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	ATO2	P32907	282 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	STB6	P36085	766 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	ERV46	P39727	415 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	AYR1	P40471	297 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	MSS2	P40990	351 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	SIP4	P46954	829 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	SHE4	P51534	789 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	PEF1	P53238	335 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	SNO2	P53823	222 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	ASI1	P54074	624 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	REC102	Q02721	264 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	MET31	Q03081	177 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	MMT1	Q03218	510 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	RSN1	Q03516	953 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	YMR206W	Q03695	313 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	PPN1	Q04119	674 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	EMI1	Q04406	187 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	YPR114W	Q06107	315 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	VPS36	Q06696	566 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	YOL131W	Q08270	108 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	PST1	Q12355	444 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	DAP2	P18962	818 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	CLB2	P24869	491 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	YCL049C	P25577	312 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	ITR2	P30606	609 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	RIB7	P33312	244 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	TIP20	P33891	701 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	TPO5	P36029	618 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	GOS1	P38736	223 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	PCL5	P38794	229 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	DUN1	P39009	513 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
TRS33	YOR115C	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66

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