RNA–Protein interactions for RNA: YLL055W

YCT1, Transcript of High-affinity cysteine-specific transporter, yeast

Gene YCT1, Length 1,596 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YCT1	YLL055W	BUG1	Q12191	341 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	RBD2	Q12270	262 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	SMC6	Q12749	1114 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	SPO12	P17123	173 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	BRF1	P29056	596 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	DBF4	P32325	704 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	TFB1	P32776	642 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	RSC1	P53236	928 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	VPS9	P54787	451 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	MEH1	Q02205	184 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	OAZ1	Q02803	292 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	PEX25	Q02969	394 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	ERO1	Q03103	563 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	DCS1	Q06151	350 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	CYC3	P06182	269 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	PDX1	P16451	410 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	APE4	P38821	490 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	ACL4	Q03771	387 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	YDR131C	Q03899	556 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	RAD57	P25301	460 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	RPC53	P25441	422 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	POP5	P28005	173 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	KAR9	P32526	644 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	SPR1	P32603	445 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	CAJ1	P39101	391 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	JLP2	P40206	208 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	SFH5	P47008	294 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	YLR152C	P54072	576 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	HOT1	Q03213	719 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	BCH1	Q05029	724 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	FDH1	Q08911	376 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	SRL2	Q12020	392 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	MED2	Q12124	431 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	YRM1	Q12340	786 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	ERV1	P27882	189 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	JEM1	P40358	645 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	TIS11	P47977	285 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	OCA2	P53949	197 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	YMR027W	Q04371	470 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	MMR1	Q06324	491 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	IRC25	Q07951	179 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	ATG34	Q12292	412 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	HXT1	P32465	570 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	ANP1	P32629	500 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	SLM4	P38247	162 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	RRT2	P38332	387 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	SHY1	P53266	389 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	CLB1	P24868	471 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	YBR056W	P38081	501 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	RMT2	Q03305	412 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	URH1	Q04179	340 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	VPS54	Q12071	889 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	MTR10	Q99189	972 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	SPT7	P35177	1332 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	MRPL10	P36520	322 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	CHK1	P38147	527 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	MDE1	P47095	244 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	CIK1	Q01649	594 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	ISA2	Q12425	185 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	COX3	P00420	269 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	IMA3	P0CW40	589 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	IMA4	P0CW41	589 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	CPR2	P23285	205 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	YCL068C	P25593	260 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	CSE2	P33308	149 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	ZIM17	P42844	174 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	TCB2	P48231	1178 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	BRO1	P48582	844 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	TOM22	P49334	152 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	YGR016W	P53209	190 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	NUP116	Q02630	1113 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	YLR345W	Q06137	509 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	NDE2	Q07500	545 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	IMA2	Q08295	589 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	RAX1	Q08760	435 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	NAM2	P11325	894 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	SER3	P40054	469 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	VHS2	P40463	436 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YCT1	YLL055W	YIL029C	P40538	142 aa		2.66	□□□□□ -1.98

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