RNA–Protein interactions for RNA: YFR056C

YFR056C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YFR056C, Length 369 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YFR056CYFR056C SUR1P33300 382 aa2.15□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C PTK1P36002 662 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C FRE2P36033 711 aa2.15□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C PCH2P38126 564 aa2.15□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C KAP104P38217 918 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C INM1P38710 295 aa2.15□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C YER079WP40052 210 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C GAT2P40209 560 aa2.15□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C CSM2P40465 213 aa2.15□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C MKT1P40850 830 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C HMS2P47175 358 aa2.15□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C YIP1P53039 248 aa2.15□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C MPS2P53159 387 aa2.15□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C PRM1P53835 661 aa2.15□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C UTP6Q02354 440 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C RPM2Q02773 1202 aa2.15□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C ABZ2Q03266 374 aa2.15□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C HCR1Q05775 265 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C BNA5Q05979 453 aa2.15□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C NDL1Q06568 189 aa2.15□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C REX4Q08237 289 aa2.15□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C RPC40P07703 335 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C CHS1P08004 1131 aa2.14□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C YAR066WP0CX18 203 aa2.14□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C YHR214WP0CX19 203 aa2.14□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C AMD1P15274 810 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C EXO70P19658 623 aa2.14□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C HSP104P31539 908 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C SRB2P34162 210 aa2.14□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C SIP2P34164 415 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C RSM22P36056 628 aa2.14□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C MSG5P38590 489 aa2.14□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C RRF1P38771 230 aa2.14□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C PCL7P40186 285 aa2.14□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C YJL213WP40896 331 aa2.14□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C ASN2P49090 572 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C SHE10P53075 577 aa2.14□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C GPI15P53961 229 aa2.14□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C PRO2P54885 456 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C IRC15Q02733 499 aa2.14□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C PRP3Q03338 469 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C MRPL51Q06090 140 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C SNT309Q06091 175 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C TLG2Q08144 397 aa2.14□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C RTC5Q12108 567 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C SFG1Q12507 346 aa2.14□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C NBL1Q3E7Y6 73 aa2.14□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C SRN2Q99176 213 aa2.14□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C INO80P53115 1489 aa2.14□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C OPI3P05375 206 aa2.13□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C MTF1P14908 341 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C SLM5P25345 492 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C PSO2P30620 661 aa2.13□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C NDI1P32340 513 aa2.13□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C LOS1P33418 1100 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C YKL097CP34245 136 aa2.13□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C YBR056WP38081 501 aa2.13□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C YHR177WP38867 453 aa2.13□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C YAL037WP39728 267 aa2.13□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C PAC11P40960 533 aa2.13□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C RPA34P47006 233 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C GWT1P47026 490 aa2.13□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C RTT101P47050 842 aa2.13□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C YDL186WP48568 277 aa2.13□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C BRO1P48582 844 aa2.13□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C FRE4P53746 719 aa2.13□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C BOR1P53838 576 aa2.13□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C TAF12Q03761 539 aa2.13□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C IPK1Q06667 281 aa2.13□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C SYO1Q07395 620 aa2.13□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C YPR022CQ12139 1133 aa2.13□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C YDL009CQ12210 107 aa2.13□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C YOR012WQ12351 137 aa2.13□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C SET6Q12529 373 aa2.13□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C RPL15AP05748 204 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C GRR1P24814 1151 aa2.12□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C CTR86P25355 563 aa2.12□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C YCR100CP25606 316 aa2.12□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C AGA1P32323 725 aa2.12□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C NIP1P32497 812 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C NDC1P32500 655 aa2.12□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C LYS1P38998 373 aaRIP-Chip data2.12□□□□□ -2.07not detected
YFR056CYFR056C RPH1P39956 796 aa2.12□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C MMF1P40185 145 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C YPS6P40583 537 aa2.12□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C GCD10P41814 478 aa2.12□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C YFR016CP43597 1233 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C EFM3P47163 339 aa2.12□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C PMT5P52867 743 aa2.12□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C YGL242CP53066 181 aa2.12□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C HST1P53685 503 aa2.12□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C STD1Q02794 444 aa2.12□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C PNG1Q02890 363 aa2.12□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C ADD37Q03233 198 aa2.12□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C ECM7Q06200 448 aa2.12□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C RRP9Q06506 573 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C ASA1Q06822 443 aa2.12□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C NSE1Q07913 336 aa2.12□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C PEX27Q08580 376 aa2.12□□□□□ -2.07
YFR056CYFR056C RUP1Q12242 671 aa2.12□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.6 ms