RNA–Protein interactions for RNA: YBR167C

POP7, Transcript of Subunit of both RNase MRP and nuclear RNase P, yeast

Gene POP7, Length 423 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
POP7	YBR167C	TAF12	Q03761	539 aa		2.91	□□□□□ -1.94
POP7	YBR167C	ISN1	Q99312	450 aa		2.91	□□□□□ -1.94
POP7	YBR167C	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	PCL1	P24867	279 aa		2.9	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	GEX1	P25596	615 aa		2.9	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	KAR9	P32526	644 aa		2.9	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	YBR056W	P38081	501 aa		2.9	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	YAL037W	P39728	267 aa		2.9	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	JLP2	P40206	208 aa		2.9	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	YMR130W	Q04223	302 aa		2.9	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	BCH1	Q05029	724 aa		2.9	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	HOM3	P10869	527 aa		2.89	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	BRF1	P29056	596 aa		2.89	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	TFB1	P32776	642 aa		2.89	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	UTH1	P36135	365 aa		2.89	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	SFH5	P47008	294 aa		2.89	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	2.89	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	2.89	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	OCA2	P53949	197 aa		2.89	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	HAL1	Q01766	294 aa		2.89	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	NUP116	Q02630	1113 aa		2.89	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	DCS1	Q06151	350 aa		2.89	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	SRL2	Q12020	392 aa		2.89	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	2.88	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	2.88	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	CSE2	P33308	149 aa		2.88	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	MDE1	P47095	244 aa		2.88	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	BRO1	P48582	844 aa		2.88	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	CHK1	P38147	527 aa		2.87	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	YIL029C	P40538	142 aa		2.87	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	ADA2	Q02336	434 aa		2.87	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	ACL4	Q03771	387 aa		2.87	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	IMA3	P0CW40	589 aa		2.86	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	IMA4	P0CW41	589 aa		2.86	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	MTQ1	P53944	314 aa		2.86	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	SPC19	Q03954	165 aa		2.86	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	NDE2	Q07500	545 aa		2.86	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	IMA2	Q08295	589 aa		2.86	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	BUG1	Q12191	341 aa		2.86	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	ATG34	Q12292	412 aa		2.86	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	AHC1	Q12433	566 aa		2.86	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	IZH2	Q12442	317 aa		2.86	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	YCL068C	P25593	260 aa		2.85	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	ADK2	P26364	225 aa		2.85	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	NUP2	P32499	720 aa		2.85	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	COX14	P39103	70 aa		2.85	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	2.85	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	HOT1	Q03213	719 aa		2.85	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	CCE1	Q03702	353 aa		2.85	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	VPS54	Q12071	889 aa		2.85	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	2.85	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	ERV1	P27882	189 aa		2.84	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	2.84	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	SLM4	P38247	162 aa		2.84	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	SBE22	P38814	852 aa		2.84	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	GAB1	P41733	394 aa		2.84	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	2.84	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	URH1	Q04179	340 aa		2.84	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	MMR1	Q06324	491 aa		2.84	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	RAX1	Q08760	435 aa		2.84	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	MED2	Q12124	431 aa		2.84	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	MTR10	Q99189	972 aa		2.84	□□□□□ -1.95
POP7	YBR167C	CLB1	P24868	471 aa		2.83	□□□□□ -1.96
POP7	YBR167C	RPC53	P25441	422 aa		2.83	□□□□□ -1.96
POP7	YBR167C	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
POP7	YBR167C	TSA2	Q04120	196 aa		2.83	□□□□□ -1.96
POP7	YBR167C	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	2.83	□□□□□ -1.96
POP7	YBR167C	PDX1	P16451	410 aa		2.82	□□□□□ -1.96
POP7	YBR167C	HEL1	P36113	551 aa		2.82	□□□□□ -1.96
POP7	YBR167C	MIG3	P39943	394 aa		2.82	□□□□□ -1.96
POP7	YBR167C	MRM2	P53123	320 aa		2.82	□□□□□ -1.96
POP7	YBR167C	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
POP7	YBR167C	STD1	Q02794	444 aa		2.82	□□□□□ -1.96
POP7	YBR167C	MMT1	Q03218	510 aa		2.82	□□□□□ -1.96
POP7	YBR167C	RMT2	Q03305	412 aa		2.82	□□□□□ -1.96
POP7	YBR167C	YDR131C	Q03899	556 aa		2.82	□□□□□ -1.96
POP7	YBR167C	LIP2	Q06005	328 aa		2.82	□□□□□ -1.96
POP7	YBR167C	RIF2	Q06208	395 aa		2.82	□□□□□ -1.96
POP7	YBR167C	PLP2	Q12017	286 aa		2.82	□□□□□ -1.96
POP7	YBR167C	JID1	Q12350	301 aa		2.82	□□□□□ -1.96
POP7	YBR167C	COX3	P00420	269 aa		2.81	□□□□□ -1.96
POP7	YBR167C	MSI1	P13712	422 aa		2.81	□□□□□ -1.96
POP7	YBR167C	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.81	□□□□□ -1.96	not detected
POP7	YBR167C	RTC2	P38279	296 aa		2.81	□□□□□ -1.96
POP7	YBR167C	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
POP7	YBR167C	DFG10	P40526	253 aa		2.81	□□□□□ -1.96
POP7	YBR167C	ZIM17	P42844	174 aa		2.81	□□□□□ -1.96
POP7	YBR167C	YFR057W	P43625	151 aa		2.81	□□□□□ -1.96
POP7	YBR167C	BIR1	P47134	954 aa		2.81	□□□□□ -1.96
POP7	YBR167C	MDM36	Q06820	579 aa		2.81	□□□□□ -1.96
POP7	YBR167C	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 27.3 ms