RNA–Protein interactions for RNA: YMR118C

SHH3, Transcript of Putative mitochondrial inner membrane protein of unknown function, yeast

Gene SHH3, Length 591 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SHH3	YMR118C	PTR3	P43606	678 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	MNN5	P46982	586 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	IRC18	P47056	224 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	MDE1	P47095	244 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	GPI8	P49018	411 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	MET13	P53128	600 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	YGR045C	P53229	120 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	YGR168C	P53293	376 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	TIM13	P53299	105 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	EFM6	P53970	246 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	CDC14	Q00684	551 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	REG1	Q00816	1014 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	RRN5	Q02983	363 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	ECM11	Q04110	302 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	ARA2	Q04212	335 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	RCO1	Q04779	684 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	COX20	Q04935	205 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	BSC2	Q05611	235 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	YLR345W	Q06137	509 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	VPS36	Q06696	566 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	SWC7	Q06707	132 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	MFG1	Q07684	458 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	COS7	Q07788	383 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	YLL007C	Q07799	665 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	THP1	Q08231	455 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	YNG1	Q08465	219 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	PEX27	Q08580	376 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	MCD1	Q12158	566 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	YOR214C	Q12282	236 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	YDR061W	Q12298	539 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	AFI1	Q99222	893 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	URA3	P03962	267 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	RED1	P14291	827 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	DAP2	P18962	818 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	OCA4	P25366	362 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	YCR099C	P25657	155 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	THI4	P32318	326 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	ZRT3	P34240	503 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	TAF14	P35189	244 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	PIM1	P36775	1133 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	FUI1	P38196	639 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	YBR053C	P38235	358 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	MBA1	P38300	278 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	ARP1	P38696	384 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	STB5	P38699	743 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	RIM4	P38741	713 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	MLH1	P38920	769 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	SPO73	P40031	143 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	PCL6	P40038	420 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	ELO3	P40319	345 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	OPT1	P40897	799 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	GAB1	P41733	394 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	SSY5	P47002	699 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	COG1	P53079	417 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	MRH4	P53166	561 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	PRM8	P53174	237 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	SHY1	P53266	389 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	MRPL22	P53881	309 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	YAT1	P80235	687 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.36	□□□□□ -1.87	not detected
SHH3	YMR118C	NUP100	Q02629	959 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	MSC2	Q03455	724 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	YMD8	Q03697	442 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	DLT1	Q04216	342 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	YDR124W	Q04608	324 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	AIM32	Q04689	311 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	RNH1	Q04740	348 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	PMT7	Q06644	662 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	YLR031W	Q07978	186 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	MLH3	Q12083	715 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	MDM32	Q12171	622 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	YLR126C	Q12288	251 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	ARP7	Q12406	477 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SHH3	YMR118C	YDL199C	Q12407	687 aa		3.36	□□□□□ -1.87

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