RNA–Protein interactions for RNA: YJL209W

CBP1, Transcript of Mitochondrial protein, regulator of COB mRNA stability and translation, yeast

Gene CBP1, Length 1,965 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CBP1	YJL209W	YDR262W	Q12331	272 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	GIS3	Q12418	502 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	SPO24	Q3E752	67 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	ERG4	P25340	473 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	ADY2	P25613	283 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	MRPL9	P31334	269 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	SPR1	P32603	445 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	EMP70	P32802	667 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	RGT1	P32862	1170 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	BNA4	P38169	460 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	INM1	P38710	295 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	YHR045W	P38775	560 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	UBA4	P38820	440 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	YER085C	P40058	173 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	NSG2	P53898	299 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	YNL146W	P53906	100 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	SHR3	Q02774	210 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	ATG26	Q06321	1198 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	PEX27	Q08580	376 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	RNH203	Q12338	110 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	YRM1	Q12340	786 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	CHS1	P08004	1131 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	GPA1	P08539	472 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.74	□□□□□ -1.65	not detected
CBP1	YJL209W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.74	□□□□□ -1.65	not detected
CBP1	YJL209W	YKR015C	P36111	568 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	IML3	P38265	245 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	SNG1	P46950	547 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	PGA2	P53903	129 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	AAT1	Q01802	451 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	YMR087W	Q04299	284 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	PDR8	Q06149	701 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	SIP3	P38717	1229 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	TCD1	P38756	429 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	YDL186W	P48568	277 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	YGL117W	P53133	265 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	CGR1	P53188	120 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	KTR6	P54070	446 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	ALG7	P07286	448 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	MSF1	P08425	469 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	TYR1	P20049	452 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	NUP1	P20676	1076 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	STE11	P23561	717 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	DAL2	P25335	343 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	ECT1	P33412	323 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	SBE22	P38814	852 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	OTU1	P43558	301 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	FMP33	P46998	180 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	LOH1	P47055	219 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	PMT5	P52867	743 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	HOP2	P53187	214 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	YNL260C	P53846	198 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	SNZ1	Q03148	297 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	HSP31	Q04432	237 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	RRN11	Q04712	507 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	THI3	Q07471	609 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	NRT1	Q08485	598 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	YMC2	P38087	329 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	STE24	P47154	453 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	BUD32	P53323	261 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	MRPL35	Q06678	367 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	MED7	Q08278	222 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	PUS9	Q12069	462 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	SUC2	P00724	532 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CBP1	YJL209W	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CBP1	YJL209W	CDC21	P06785	304 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CBP1	YJL209W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CBP1	YJL209W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CBP1	YJL209W	HXT1	P32465	570 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CBP1	YJL209W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CBP1	YJL209W	RPC25	P35718	212 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CBP1	YJL209W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CBP1	YJL209W	PPS1	P38148	807 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CBP1	YJL209W	ARG2	P40360	574 aa		4.71	□□□□□ -1.66

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