RNA–Protein interactions for RNA: YJL036W

SNX4, Transcript of Sorting nexin, yeastyeast

Gene SNX4, Length 1,272 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNX4YJL036W NRT1Q08485 598 aa3.29□□□□□ -1.88
SNX4YJL036W ARP6Q12509 438 aa3.29□□□□□ -1.88
SNX4YJL036W HIS4P00815 799 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SNX4YJL036W STE3P06783 470 aa3.28□□□□□ -1.88
SNX4YJL036W NFT1P0CE68 1218 aa3.28□□□□□ -1.88
SNX4YJL036W GRR1P24814 1151 aa3.28□□□□□ -1.88
SNX4YJL036W YCR007CP25354 239 aa3.28□□□□□ -1.88
SNX4YJL036W MGR1P25573 417 aa3.28□□□□□ -1.88
SNX4YJL036W DAL80P26343 269 aa3.28□□□□□ -1.88
SNX4YJL036W PCH2P38126 564 aa3.28□□□□□ -1.88
SNX4YJL036W GPI16P38875 610 aa3.28□□□□□ -1.88
SNX4YJL036W YDR089WP38966 869 aa3.28□□□□□ -1.88
SNX4YJL036W FAU1P40099 211 aa3.28□□□□□ -1.88
SNX4YJL036W GAT2P40209 560 aa3.28□□□□□ -1.88
SNX4YJL036W RTS2P40962 232 aa3.28□□□□□ -1.88
SNX4YJL036W TES1P41903 349 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SNX4YJL036W YGL082WP53155 381 aa3.28□□□□□ -1.88
SNX4YJL036W PCP1P53259 346 aa3.28□□□□□ -1.88
SNX4YJL036W GIP3Q03016 1276 aa3.28□□□□□ -1.88
SNX4YJL036W SLD5Q03406 294 aa3.28□□□□□ -1.88
SNX4YJL036W MSS11Q03825 758 aa3.28□□□□□ -1.88
SNX4YJL036W RRB1Q04225 511 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SNX4YJL036W REX4Q08237 289 aa3.28□□□□□ -1.88
SNX4YJL036W BUG1Q12191 341 aa3.28□□□□□ -1.88
SNX4YJL036W RUP1Q12242 671 aa3.28□□□□□ -1.88
SNX4YJL036W RKM5Q12367 367 aa3.28□□□□□ -1.88
SNX4YJL036W INO80P53115 1489 aa3.28□□□□□ -1.88
SNX4YJL036W EXO70P19658 623 aa3.27□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W RAD57P25301 460 aa3.27□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W RDS1P25611 832 aa3.27□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W BUB3P26449 341 aa3.27□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W SMY1P32364 656 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W CYS4P32582 507 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W SSE1P32589 693 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W YSC83P32792 385 aa3.27□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W VPS17P32913 551 aa3.27□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W YNK1P36010 153 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W YPK3P38070 525 aa3.27□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W QDR3P38227 689 aa3.27□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W ARC40P38328 384 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W MSG5P38590 489 aa3.27□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W INM1P38710 295 aa3.27□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W YER079WP40052 210 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W RTT105P40063 208 aa3.27□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W PAC11P40960 533 aa3.27□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W TRS85P46944 698 aa3.27□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W EFM3P47163 339 aa3.27□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W BRO1P48582 844 aa3.27□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W YGL260WP53056 76 aa3.27□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W MPS2P53159 387 aa3.27□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W ARP5P53946 755 aa3.27□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W UTP6Q02354 440 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W ECI1Q05871 280 aa3.27□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W NSE1Q07913 336 aa3.27□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W GSH2Q08220 491 aa3.27□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W YLL056CQ12177 298 aa3.27□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W LSP1Q12230 341 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W DST1P07273 309 aa3.26□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W SEC62P21825 274 aa3.26□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W FRE1P32791 686 aa3.26□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W RIB7P33312 244 aa3.26□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W RSM22P36056 628 aa3.26□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W YBL028CP38202 106 aa3.26□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W SPP381P38282 291 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W RRP3P38712 501 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W OSH3P38713 996 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W ISC1P40015 477 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W CSM2P40465 213 aa3.26□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W HMS2P47175 358 aa3.26□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W SAM50P53969 484 aa3.26□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W ABZ2Q03266 374 aa3.26□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W TAF12Q03761 539 aa3.26□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W YDR415CQ04033 374 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W SMA2Q04658 369 aa3.26□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W IPK1Q06667 281 aa3.26□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W THI20Q08224 551 aa3.26□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W BSC1Q12140 328 aa3.26□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W RPL42AP0CX27 106 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W RPL42BP0CX28 106 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W HNM1P19807 563 aa3.25□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W ACH1P32316 526 aa3.25□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W NIP1P32497 812 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W ECM15P35195 104 aa3.25□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W MIC60P36112 540 aa3.25□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W SPC34P36131 295 aa3.25□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W YCR041WP37265 110 aa3.25□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W MET30P39014 640 aa3.25□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W TDA7P53882 636 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W ERV25P54837 211 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W YMR111CQ04461 462 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W PEX27Q08580 376 aa3.25□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W PFK27Q12471 397 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W SFG1Q12507 346 aa3.25□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W RAD61Q99359 647 aa3.25□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W CHS1P08004 1131 aa3.24□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W IMA3P0CW40 589 aa3.24□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W IMA4P0CW41 589 aa3.24□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W YAR066WP0CX18 203 aa3.24□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W YHR214WP0CX19 203 aa3.24□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W PTK1P36002 662 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
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