RNA–Protein interactions for RNA: YGR163W

GTR2, Transcript of Putative GTP binding protein, yeast

Gene GTR2, Length 1,026 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GTR2	YGR163W	YGL138C	P53122	345 aa		3.13	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	RSC1	P53236	928 aa		3.13	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	FRE4	P53746	719 aa		3.13	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	HOM3	P10869	527 aa		3.12	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	SEC63	P14906	663 aa		3.12	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	LSB5	P25369	354 aa		3.12	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	YME2	P32843	850 aa		3.12	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	KKQ8	P36004	724 aa		3.12	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	MRPL4	P36517	319 aa		3.12	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	FAA2	P39518	744 aa		3.12	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	COS5	P47187	383 aa		3.12	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	COS7	Q07788	383 aa		3.12	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	TMS1	Q12116	473 aa		3.12	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	VAM3	Q12241	283 aa		3.12	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	PET123	P17558	318 aa		3.11	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	DAL2	P25335	343 aa		3.11	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	BEM1	P29366	551 aa		3.11	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	PIM1	P36775	1133 aa		3.11	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	RFC3	P38629	340 aa		3.11	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	HMS2	P47175	358 aa		3.11	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	SKO1	Q02100	647 aa		3.11	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	KAP120	Q02932	1032 aa		3.11	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	PPM1	Q04081	328 aa		3.11	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	DON1	Q05610	365 aa		3.11	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	SPO7	P18410	259 aa		3.1	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	RHB1	P25378	209 aa		3.1	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	ERV1	P27882	189 aa		3.1	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	SSU1	P41930	458 aa		3.1	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	RSN1	Q03516	953 aa		3.1	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	BET5	Q03630	159 aa		3.1	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	AIM32	Q04689	311 aa		3.1	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	ROY1	Q04847	553 aa		3.1	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	SCEI	P03882	235 aa		3.09	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	SLY1	P22213	666 aa		3.09	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	YCR051W	P25631	222 aa		3.09	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	HIR2	P32480	875 aa		3.09	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	MMS4	P38257	691 aa		3.09	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	TCB2	P48231	1178 aa		3.09	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	HXT11	P54862	567 aa		3.09	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	ADD37	Q03233	198 aa		3.09	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	RMT2	Q03305	412 aa		3.09	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	TAF12	Q03761	539 aa		3.09	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	MDM30	Q05930	598 aa		3.09	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	MRPL35	Q06678	367 aa		3.09	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	HRT3	Q12347	344 aa		3.09	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	ORT1	Q12375	292 aa		3.09	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	CLN1	P20437	546 aa		3.08	□□□□□ -1.92
GTR2	YGR163W	CLB1	P24868	471 aa		3.08	□□□□□ -1.92
GTR2	YGR163W	GEX1	P25596	615 aa		3.08	□□□□□ -1.92
GTR2	YGR163W	ITR1	P30605	584 aa		3.08	□□□□□ -1.92
GTR2	YGR163W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
GTR2	YGR163W	MNS1	P32906	549 aa		3.08	□□□□□ -1.92
GTR2	YGR163W	PAN6	P40459	309 aa		3.08	□□□□□ -1.92
GTR2	YGR163W	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
GTR2	YGR163W	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
GTR2	YGR163W	MED2	Q12124	431 aa		3.08	□□□□□ -1.92
GTR2	YGR163W	AFI1	Q99222	893 aa		3.08	□□□□□ -1.92
GTR2	YGR163W	TRP1	P00912	224 aa		3.07	□□□□□ -1.92
GTR2	YGR163W	CLN3	P13365	580 aa		3.07	□□□□□ -1.92
GTR2	YGR163W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
GTR2	YGR163W	CTR86	P25355	563 aa		3.07	□□□□□ -1.92
GTR2	YGR163W	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
GTR2	YGR163W	GPI15	P53961	229 aa		3.07	□□□□□ -1.92
GTR2	YGR163W	PEX25	Q02969	394 aa		3.07	□□□□□ -1.92
GTR2	YGR163W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
GTR2	YGR163W	RMD5	Q12508	421 aa		3.07	□□□□□ -1.92
GTR2	YGR163W	URA4	P20051	364 aa		3.06	□□□□□ -1.92
GTR2	YGR163W	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
GTR2	YGR163W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
GTR2	YGR163W	SWD3	P38123	315 aa		3.06	□□□□□ -1.92
GTR2	YGR163W	YAL037W	P39728	267 aa		3.06	□□□□□ -1.92
GTR2	YGR163W	AZR1	P50080	613 aa		3.06	□□□□□ -1.92
GTR2	YGR163W	GIP3	Q03016	1276 aa		3.06	□□□□□ -1.92
GTR2	YGR163W	YMR130W	Q04223	302 aa		3.06	□□□□□ -1.92
GTR2	YGR163W	SOR2	Q07786	357 aa		3.06	□□□□□ -1.92
GTR2	YGR163W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
GTR2	YGR163W	BUG1	Q12191	341 aa		3.06	□□□□□ -1.92
GTR2	YGR163W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
GTR2	YGR163W	POP5	P28005	173 aa		3.05	□□□□□ -1.92
GTR2	YGR163W	BRF1	P29056	596 aa		3.05	□□□□□ -1.92
GTR2	YGR163W	DBF4	P32325	704 aa		3.05	□□□□□ -1.92
GTR2	YGR163W	TFB1	P32776	642 aa		3.05	□□□□□ -1.92
GTR2	YGR163W	RRN10	P38204	145 aa		3.05	□□□□□ -1.92
GTR2	YGR163W	YBR137W	P38276	179 aa		3.05	□□□□□ -1.92
GTR2	YGR163W	RRT2	P38332	387 aa		3.05	□□□□□ -1.92
GTR2	YGR163W	MSG5	P38590	489 aa		3.05	□□□□□ -1.92

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