RNA–Protein interactions for RNA: YGL145W

TIP20, Transcript of Peripheral membrane protein required for COPI vesicle fusion to the ER, yeast

Gene TIP20, Length 2,106 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TIP20	YGL145W	TYR1	P20049	452 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	not detected
TIP20	YGL145W	TPO5	P36029	618 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	SPC97	P38863	823 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	HXT9	P40885	567 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	YJR154W	P47181	346 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	HNM1	P19807	563 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	OCT1	P35999	772 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	MRPL37	P36532	105 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	ERG7	P38604	731 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	YGL242C	P53066	181 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	PIG1	Q06216	648 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	STE2	D6VTK4	431 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	SUC2	P00724	532 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	ROT2	P38138	954 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	SWC5	P38326	303 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	BZZ1	P38822	633 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	RTT107	P38850	1070 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	BRO1	P48582	844 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	SHR3	Q02774	210 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	SPO19	Q03029	223 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	HSP31	Q04432	237 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	ARV1	Q06541	321 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	NSE1	Q07913	336 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	DNF1	P32660	1571 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	PEP5	P12868	1029 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	UGA1	P17649	471 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	PPZ1	P26570	692 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	YPS6	P40583	537 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	POP1	P41812	875 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	CAB5	Q03941	241 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	VAC14	Q06708	880 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	MCH4	Q08268	501 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	PDR10	P51533	1564 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	IRC20	Q06554	1556 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	CHS1	P08004	1131 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	HXT2	P23585	541 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	DMC1	P25453	334 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	MGR1	P25573	417 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	YMC1	P32331	307 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	ECM25	P32525	599 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	BAR1	P12630	587 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	MSS51	P32335	436 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	RGT1	P32862	1170 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	INM1	P38710	295 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	END3	P39013	349 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	SCC4	P40090	624 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	PAC11	P40960	533 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	UBP8	P50102	471 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	YPL014W	Q02606	381 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	ERV41	Q04651	352 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	PDR8	Q06149	701 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	YPR078C	Q06813	372 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	RNH203	Q12338	110 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	LDB17	Q12342	491 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	RMD5	Q12508	421 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	TY1B-JR2	P47100	1755 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	TY1B-ER2	Q03619	1755 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	TY1B-MR1	Q04214	1755 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	TY1B-MR2	Q04670	1755 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	TY1B-LR1	Q12088	1755 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	TY1B-NL1	Q12112	1755 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	TY1B-GR1	Q12141	1755 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	TY1B-BL	Q12490	1755 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	QCR6	P00127	147 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	GSY2	P27472	705 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	CTS1	P29029	562 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	YHC3	P47040	408 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	YJL043W	P47053	257 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	GTO1	P48239	356 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	ORC5	P50874	479 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	MND1	P53102	219 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	CSI1	Q04368	295 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	RKM5	Q12367	367 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	MAS1	P10507	462 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	YCL068C	P25593	260 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	RAD24	P32641	659 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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