RNA–Protein interactions for RNA: YER009W

NTF2, Transcript of Nuclear envelope protein, yeastyeast

Gene NTF2, Length 378 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NTF2YER009W ILV5P06168 395 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
NTF2YER009W CLN1P20437 546 aa2.77□□□□□ -1.97
NTF2YER009W CPR4P25334 318 aa2.77□□□□□ -1.97
NTF2YER009W LSB5P25369 354 aa2.77□□□□□ -1.97
NTF2YER009W SMY1P32364 656 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
NTF2YER009W APE3P37302 537 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
NTF2YER009W YBR139WP38109 508 aa2.77□□□□□ -1.97
NTF2YER009W SLM4P38247 162 aa2.77□□□□□ -1.97
NTF2YER009W RRT2P38332 387 aa2.77□□□□□ -1.97
NTF2YER009W FAA2P39518 744 aa2.77□□□□□ -1.97
NTF2YER009W ZIM17P42844 174 aa2.77□□□□□ -1.97
NTF2YER009W PHO86P46956 311 aa2.77□□□□□ -1.97
NTF2YER009W TCB2P48231 1178 aa2.77□□□□□ -1.97
NTF2YER009W GIS2P53849 153 aaKnown RBP RIP-Chip data2.77□□□□□ -1.97 RIP-Chip
NTF2YER009W HXT11P54862 567 aa2.77□□□□□ -1.97
NTF2YER009W AIM32Q04689 311 aa2.77□□□□□ -1.97
NTF2YER009W DCS1Q06151 350 aa2.77□□□□□ -1.97
NTF2YER009W MMR1Q06324 491 aa2.77□□□□□ -1.97
NTF2YER009W SKI7Q08491 747 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
NTF2YER009W YOR387CQ08910 206 aa2.77□□□□□ -1.97
NTF2YER009W RSA1Q08932 381 aa2.77□□□□□ -1.97
NTF2YER009W ERV2Q12284 196 aa2.77□□□□□ -1.97
NTF2YER009W TY1B-AO13527 1196 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
NTF2YER009W HHF1P02309 103 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
NTF2YER009W SPT15P13393 240 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
NTF2YER009W SLY1P22213 666 aa2.76□□□□□ -1.97
NTF2YER009W CPR2P23285 205 aa2.76□□□□□ -1.97
NTF2YER009W DEG1P31115 442 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
NTF2YER009W PAD1P33751 242 aaKnown RBP RIP-Chip data2.76□□□□□ -1.97not detected
NTF2YER009W YBL059WP34224 193 aa2.76□□□□□ -1.97
NTF2YER009W RRN10P38204 145 aa2.76□□□□□ -1.97
NTF2YER009W RFS1P38234 210 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
NTF2YER009W NDT80P38830 627 aa2.76□□□□□ -1.97
NTF2YER009W SPG5P42933 373 aa2.76□□□□□ -1.97
NTF2YER009W WWM1P43582 211 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
NTF2YER009W RPT4P53549 437 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
NTF2YER009W TOF1P53840 1238 aa2.76□□□□□ -1.97
NTF2YER009W GPI15P53961 229 aa2.76□□□□□ -1.97
NTF2YER009W ELP3Q02908 557 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
NTF2YER009W GIP3Q03016 1276 aa2.76□□□□□ -1.97
NTF2YER009W YMR181CQ03231 154 aa2.76□□□□□ -1.97
NTF2YER009W RSN1Q03516 953 aa2.76□□□□□ -1.97
NTF2YER009W BET5Q03630 159 aa2.76□□□□□ -1.97
NTF2YER009W TAF12Q03761 539 aa2.76□□□□□ -1.97
NTF2YER009W PBA1Q05778 276 aa2.76□□□□□ -1.97
NTF2YER009W VPS54Q12071 889 aa2.76□□□□□ -1.97
NTF2YER009W RMD5Q12508 421 aa2.76□□□□□ -1.97
NTF2YER009W SPO7P18410 259 aa2.75□□□□□ -1.97
NTF2YER009W NAM9P27929 486 aa2.75□□□□□ -1.97
NTF2YER009W VMA8P32610 256 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
NTF2YER009W SDH3P33421 198 aa2.75□□□□□ -1.97
NTF2YER009W KKQ8P36004 724 aa2.75□□□□□ -1.97
NTF2YER009W SRP72P38688 640 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
NTF2YER009W RRP4P38792 359 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
NTF2YER009W MTC6P38849 526 aa2.75□□□□□ -1.97
NTF2YER009W YAL037WP39728 267 aa2.75□□□□□ -1.97
NTF2YER009W PRM5P40476 318 aa2.75□□□□□ -1.97
NTF2YER009W NCA3P46955 337 aa2.75□□□□□ -1.97
NTF2YER009W PHB2P50085 310 aa2.75□□□□□ -1.97
NTF2YER009W YGL242CP53066 181 aa2.75□□□□□ -1.97
NTF2YER009W OCA2P53949 197 aa2.75□□□□□ -1.97
NTF2YER009W PPM1Q04081 328 aa2.75□□□□□ -1.97
NTF2YER009W TSR1Q07381 788 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
NTF2YER009W MED2Q12124 431 aa2.75□□□□□ -1.97
NTF2YER009W BUG1Q12191 341 aa2.75□□□□□ -1.97
NTF2YER009W SMC6Q12749 1114 aa2.75□□□□□ -1.97
NTF2YER009W ADE4P04046 510 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
NTF2YER009W MDH1P17505 334 aaKnown RBP RIP-Chip data2.74□□□□□ -1.97not detected
NTF2YER009W YBR137WP38276 179 aa2.74□□□□□ -1.97
NTF2YER009W PCF11P39081 626 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
NTF2YER009W SER3P40054 469 aa2.74□□□□□ -1.97
NTF2YER009W TOM22P49334 152 aa2.74□□□□□ -1.97
NTF2YER009W HEL2Q05580 639 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
NTF2YER009W SNX3Q08826 162 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
NTF2YER009W MTR10Q99189 972 aa2.74□□□□□ -1.97
NTF2YER009W COX3P00420 269 aa2.73□□□□□ -1.97
NTF2YER009W SPO12P17123 173 aa2.73□□□□□ -1.97
NTF2YER009W NIP1P32497 812 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
NTF2YER009W YOX1P34161 385 aa2.73□□□□□ -1.97
NTF2YER009W PTH1P38876 190 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
NTF2YER009W AZR1P50080 613 aa2.73□□□□□ -1.97
NTF2YER009W YML6P51998 286 aa2.73□□□□□ -1.97
NTF2YER009W OAZ1Q02803 292 aa2.73□□□□□ -1.97
NTF2YER009W SMA2Q04658 369 aa2.73□□□□□ -1.97
NTF2YER009W TMS1Q12116 473 aa2.73□□□□□ -1.97
NTF2YER009W HOM3P10869 527 aa2.72□□□□□ -1.97
NTF2YER009W ARO3P14843 370 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
NTF2YER009W ARO2P28777 376 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
NTF2YER009W MUD1P32605 298 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
NTF2YER009W PXA2P34230 853 aa2.72□□□□□ -1.97
NTF2YER009W ASC1P38011 319 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
NTF2YER009W VHS2P40463 436 aa2.72□□□□□ -1.97
NTF2YER009W REE1P40893 198 aa2.72□□□□□ -1.97
NTF2YER009W YGR210CP42942 411 aa2.72□□□□□ -1.97
NTF2YER009W YGR111WP53265 400 aa2.72□□□□□ -1.97
NTF2YER009W HER2Q03557 464 aa2.72□□□□□ -1.97
NTF2YER009W MRPL35Q06678 367 aa2.72□□□□□ -1.97
NTF2YER009W SRL2Q12020 392 aa2.72□□□□□ -1.97
NTF2YER009W AEP3Q12089 606 aa2.72□□□□□ -1.97
NTF2YER009W ATG34Q12292 412 aa2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.9 ms