RNA–Protein interactions for RNA: YDR342C

HXT7, Transcript of High-affinity glucose transporter, yeast

Gene HXT7, Length 1,713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HXT7	YDR342C	NMD5	P46970	1048 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	AIM22	P47051	409 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	YKR005C	Q02203	525 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	TLG1	Q03322	224 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	TUS1	Q06412	1307 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	HIP1	P06775	603 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	CLN3	P13365	580 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	SPS22	P25380	463 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	PIM1	P36775	1133 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	WSS1	P38838	269 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	RTT105	P40063	208 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	YIL060W	P40519	144 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	RPC17	P47076	161 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	BSP1	Q06604	576 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	NSE1	Q07913	336 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	UAF30	Q08747	228 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	RAP1	P11938	827 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	VPH2	P32341	215 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	YME1	P32795	747 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	CSE1	P33307	960 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	HOT13	P36078	116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	TUL1	P36096	758 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	YHR218W	P38899	603 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	SHE4	P51534	789 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	RSM23	Q01163	450 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	SKO1	Q02100	647 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	PPM1	Q04081	328 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	PDR8	Q06149	701 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	GGA1	Q06336	557 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	VPS54	Q12071	889 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	HER1	Q12276	1246 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	RPN13	O13563	156 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	CLN1	P20437	546 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	DAL80	P26343	269 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	OCT1	P35999	772 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	PCI8	P40512	444 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	YGR149W	P48236	432 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	ALT2	P52892	507 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	KAP114	P53067	1004 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	YGL138C	P53122	345 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	PKP2	P53170	491 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	COS6	P53344	381 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	YNR068C	P53754	272 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
HXT7	YDR342C	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	MSH5	Q12175	901 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	SEY1	Q99287	776 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	POM152	P39685	1337 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	ALG1	P16661	449 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	PPH22	P23595	377 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	AST1	P35183	429 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	YBR032W	P38223	100 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	MSR1	P38714	643 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	SYG1	P40528	902 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	YJL107C	P42947	387 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	ORC5	P50874	479 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	RPM2	Q02773	1202 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	YMR160W	Q03823	816 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	SPH1	Q06160	661 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	MCH4	Q08268	501 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	SLM3	Q12093	417 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	MED2	Q12124	431 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	IES3	Q12345	250 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	RRD2	Q12461	358 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	BI2	P03873	423 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	RPC37	P36121	282 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	HSM3	P38348	480 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	RFC3	P38629	340 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	ARN1	P38731	627 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	CHS6	P40955	746 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	GAT1	P43574	510 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	PTR3	P43606	678 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	NET1	P47035	1189 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HXT7	YDR342C	COS5	P47187	383 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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