RNA–Protein interactions for RNA: YOR264W

DSE3, Transcript of Daughter cell-specific protein, may help establish daughter fate, yeast

Gene DSE3, Length 1,293 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSE3	YOR264W	HSP42	Q12329	375 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DSE3	YOR264W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DSE3	YOR264W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DSE3	YOR264W	ECM27	P47144	725 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DSE3	YOR264W	SKO1	Q02100	647 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DSE3	YOR264W	YDR131C	Q03899	556 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DSE3	YOR264W	MUM3	Q08750	479 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DSE3	YOR264W	CLB1	P24868	471 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DSE3	YOR264W	KRE2	P27809	442 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DSE3	YOR264W	HIR2	P32480	875 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DSE3	YOR264W	MMS4	P38257	691 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DSE3	YOR264W	YHR218W	P38899	603 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DSE3	YOR264W	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DSE3	YOR264W	SAS2	P40963	338 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DSE3	YOR264W	IDP2	P41939	412 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DSE3	YOR264W	YJL132W	P47014	750 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DSE3	YOR264W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DSE3	YOR264W	YPL199C	Q08954	240 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DSE3	YOR264W	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DSE3	YOR264W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DSE3	YOR264W	URA4	P20051	364 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DSE3	YOR264W	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DSE3	YOR264W	SNT1	P25357	1226 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DSE3	YOR264W	RHB1	P25378	209 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DSE3	YOR264W	CPR3	P25719	182 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DSE3	YOR264W	SIN4	P32259	974 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DSE3	YOR264W	MRP4	P32902	394 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DSE3	YOR264W	RRT5	P43607	289 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DSE3	YOR264W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DSE3	YOR264W	MRP51	Q02950	344 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DSE3	YOR264W	HIP1	P06775	603 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DSE3	YOR264W	SEC63	P14906	663 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DSE3	YOR264W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DSE3	YOR264W	PIM1	P36775	1133 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DSE3	YOR264W	YFL067W	P43537	175 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DSE3	YOR264W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DSE3	YOR264W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DSE3	YOR264W	NAT2	P37293	288 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	PCA1	P38360	1216 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	ZIM17	P42844	174 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	SSN8	P47821	323 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	YMR130W	Q04223	302 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	AIM32	Q04689	311 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	MDM30	Q05930	598 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	REX4	Q08237	289 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	ERV1	P27882	189 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	BRF1	P29056	596 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	LAM5	P43560	674 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	HNT3	Q08702	217 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	VPS54	Q12071	889 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	YPR022C	Q12139	1133 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	CLN1	P20437	546 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	PXA2	P34230	853 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	SLM4	P38247	162 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	RRT2	P38332	387 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	RFC3	P38629	340 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	HMS2	P47175	358 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	FRE4	P53746	719 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	HOT1	Q03213	719 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	YLR345W	Q06137	509 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	DCS1	Q06151	350 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	SMC6	Q12749	1114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
DSE3	YOR264W	GOR1	P53839	350 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	IBD2	P53892	351 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	ACL4	Q03771	387 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	SOR2	Q07786	357 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	SGT1	Q08446	395 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	TIM18	Q08749	192 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	SCEI	P03882	235 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	CHS1	P08004	1131 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	PMR1	P13586	950 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	HEM15	P16622	393 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	OCA2	P53949	197 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	YLL056C	Q12177	298 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	CPR2	P23285	205 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	MST28	P39552	234 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	YIL067C	P40514	678 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	TCB2	P48231	1178 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	MMR1	Q06324	491 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	MED2	Q12124	431 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	ERP4	Q12450	207 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	not detected
DSE3	YOR264W	SPO7	P18410	259 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	RIB5	P38145	238 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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