RNA–Protein interactions for RNA: YMR066W

SOV1, Transcript of Mitochondrial protein of unknown function, yeast

Gene SOV1, Length 2,697 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SOV1	YMR066W	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	YMR181C	Q03231	154 aa		0.15	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	YDR387C	Q04162	555 aa		0.15	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	0.15	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	YKU80	Q04437	629 aa		0.15	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	YDR115W	Q04598	105 aa		0.15	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	VPS38	Q05919	439 aa		0.15	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	BUG1	Q12191	341 aa		0.15	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	0.15	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	MPD2	Q99316	277 aa		0.15	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	COX4	P04037	155 aa		0.15	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	0.15	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	CDC16	P09798	840 aa		0.15	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	MSI1	P13712	422 aa		0.15	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	URA4	P20051	364 aa		0.15	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	RRT12	P25381	491 aa		0.15	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	CDC50	P25656	391 aa		0.15	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	DBF4	P32325	704 aa		0.15	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	0.15	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	PEX5	P35056	612 aa		0.15	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	SPC34	P36131	295 aa		0.15	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	MIG3	P39943	394 aa		0.15	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	0.15	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	YIL054W	P40524	105 aa		0.15	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	DOT5	P40553	215 aa		0.15	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	CDC1	P40986	491 aa		0.15	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	COQ5	P49017	307 aa		0.15	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	INN1	P53901	409 aa		0.15	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	RCO1	Q04779	684 aa		0.15	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	FSH2	Q05015	223 aa		0.15	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	FAR10	Q06001	478 aa		0.15	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	ARR1	Q06596	294 aa		0.15	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	0.15	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	0.15	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	YPR022C	Q12139	1133 aa		0.15	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	AVL9	Q12500	764 aa		0.15	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	BI3	Q9ZZW7	517 aa		0.15	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	MSM1	P22438	575 aa		0.14	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	BUB3	P26449	341 aa		0.14	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	0.14	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	LDS1	P31379	325 aa		0.14	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	YEF1	P32622	495 aa		0.14	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	SKT5	P34226	696 aa		0.14	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	DOA1	P36037	715 aa		0.14	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	PSY4	P38193	441 aa		0.14	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	YBL028C	P38202	106 aa		0.14	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	MUM2	P38236	366 aa		0.14	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	PFS1	P38872	237 aa		0.14	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	HAT2	P39984	401 aa		0.14	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	IMA5	P40884	581 aa		0.14	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	GUF1	P46943	645 aa		0.14	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	PET130	P47065	347 aa		0.14	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	FRE4	P53746	719 aa		0.14	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	AQR1	P53943	586 aa		0.14	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	RPM2	Q02773	1202 aa		0.14	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	OAZ1	Q02803	292 aa		0.14	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	YET2	Q04210	160 aa		0.14	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	PIN3	Q06449	215 aa		0.14	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	TLG2	Q08144	397 aa		0.14	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	RIM20	Q12033	661 aa		0.14	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	YPL150W	Q12152	901 aa		0.14	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	PCL9	Q12477	304 aa		0.14	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	YDL012C	Q12489	107 aa		0.14	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	VCX1	Q99385	411 aa		0.14	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	SUC2	P00724	532 aa		0.14	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	TRP1	P00912	224 aa		0.14	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.14	□□□□□ -2.39	not detected
SOV1	YMR066W	GAL80	P04387	435 aa		0.14	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	COR1	P07256	457 aa		0.14	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	NFT1	P0CE68	1218 aa		0.14	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	CLC1	P17891	233 aa		0.14	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	CKA2	P19454	339 aa		0.14	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	PGS1	P25578	521 aa		0.14	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	CSE2	P33308	149 aa		0.14	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	PCH2	P38126	564 aa		0.14	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	OM14	P38325	134 aa		0.14	□□□□□ -2.39
SOV1	YMR066W	SBE22	P38814	852 aa		0.14	□□□□□ -2.39

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