RNA–Protein interactions for RNA: YHR004C

NEM1, Transcript of Probable catalytic subunit of Nem1p-Spo7p phosphatase holoenzyme, yeast

Gene NEM1, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NEM1	YHR004C	NTG1	P31378	399 aa		3.7	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	HCS1	P34243	683 aa		3.7	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	HEL1	P36113	551 aa		3.7	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	MRPL40	P36534	297 aa		3.7	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	YDR089W	P38966	869 aa		3.7	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	PSD1	P39006	500 aa		3.7	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	AFG3	P39925	761 aa		3.7	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	EFM4	P40516	257 aa		3.7	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	NUP84	P52891	726 aa		3.7	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	TWF1	P53250	332 aa		3.7	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	ALF1	P53904	254 aa		3.7	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	PHO92	Q06390	306 aa		3.7	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	YDL009C	Q12210	107 aa		3.7	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		3.7	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	YIH1	P25637	258 aa		3.7	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	PHO91	P27514	894 aa		3.7	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	ERV1	P27882	189 aa		3.7	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	SPR1	P32603	445 aa		3.7	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	SUR1	P33300	382 aa		3.7	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	SRB2	P34162	210 aa		3.7	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	SEF1	P34228	1148 aa		3.7	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	NDT80	P38830	627 aa		3.7	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	FMP10	P40098	244 aa		3.7	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	IME4	P41833	600 aa		3.7	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	TCB2	P48231	1178 aa		3.7	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	KEL2	P50090	882 aa		3.7	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	INN1	P53901	409 aa		3.7	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	PPM1	Q04081	328 aa		3.7	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	MMR1	Q06324	491 aa		3.7	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	PLP2	Q12017	286 aa		3.7	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	PSY3	Q12318	242 aa		3.7	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	YPT6	Q99260	215 aa		3.7	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	YLR278C	Q05854	1341 aa		3.69	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	KAR3	P17119	729 aa		3.69	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	NAM9	P27929	486 aa		3.69	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	NAS2	P40555	220 aa		3.69	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	HXT14	P42833	540 aa		3.69	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	LAM5	P43560	674 aa		3.69	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	RPN14	P53196	417 aa		3.69	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	YNR068C	P53754	272 aa		3.69	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	YLR152C	P54072	576 aa		3.69	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	YML037C	Q03703	340 aa		3.69	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	RRN11	Q04712	507 aa		3.69	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	SOV1	Q04748	898 aa		3.69	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	ECM30	Q06673	1274 aa		3.69	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	SYO1	Q07395	620 aa		3.69	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	VPS54	Q12071	889 aa		3.69	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	GAL7	P08431	366 aa		3.68	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	VMA16	P23968	213 aa		3.68	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	PMT1	P33775	817 aa		3.68	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	YUH1	P35127	236 aa		3.68	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	HSM3	P38348	480 aa		3.68	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	AGX1	P43567	385 aa		3.68	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	EPL1	P43572	832 aa		3.68	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	SHE4	P51534	789 aa		3.68	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	GAL80	P04387	435 aa		3.67	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	MRE11	P32829	692 aa		3.67	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.67	□□□□□ -1.82	not detected
NEM1	YHR004C	BUR6	P40096	142 aa		3.67	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	CHS6	P40955	746 aa		3.67	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	GCD10	P41814	478 aa		3.67	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	URB2	P47108	1174 aa		3.67	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	TIS11	P47977	285 aa		3.67	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	ALT2	P52892	507 aa		3.67	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	AQR1	P53943	586 aa		3.67	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	TOF2	Q02208	771 aa		3.67	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	INA17	Q02888	182 aa		3.67	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	FIN1	Q03898	291 aa		3.67	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	YPR172W	Q06608	200 aa		3.67	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	3.67	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	AEP3	Q12089	606 aa		3.67	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	MED2	Q12124	431 aa		3.67	□□□□□ -1.82

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.5 ms