RNA–Protein interactions for RNA: YHL009W-B

YHL009W-B, Transcript of Retrotransposon TYA Gag and TYB Pol genes, yeastyeast

Gene YHL009W-B, Length 5,409 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL009W-BYHL009W-B CHO1P08456 276 aa-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B SAM35P14693 329 aa-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B APE1P14904 514 aa-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B KRE1P17260 313 aa-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B TYR1P20049 452 aa-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B CAP1P28495 268 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B SMI1P32566 505 aa-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B XRS2P33301 854 aa-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B TCM62P38228 572 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B VBA2P38358 474 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B YHK8P38776 514 aa-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B MMF1P40185 145 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B PAN6P40459 309 aa-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B YGR210CP42942 411 aa-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B UBP6P43593 499 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B ORC5P50874 479 aa-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B RTF1P53064 558 aa-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B YGL193CP53097 103 aa-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B LSG1P53145 640 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B PEX31P53203 462 aa-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B GAS3Q03655 524 aa-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B RIM9Q04734 239 aa-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B YEH2Q07950 538 aa-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B DBP10Q12389 995 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B PFK27Q12471 397 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B APM4Q99186 491 aa-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B STE3P06783 470 aa-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B DBP5P20449 482 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B YIM1P28625 365 aa-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B NDC1P32500 655 aa-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B RIB1P38066 345 aa-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B KAP104P38217 918 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B MMS4P38257 691 aa-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B RCY1P39531 840 aa-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B PRM5P40476 318 aa-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B PRM2P40534 656 aa-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B GPP1P41277 250 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B VPS53P47061 822 aa-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B TOS2P50078 622 aa-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B ATP22P50273 684 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B SAP4P53036 818 aa-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B USA1Q03714 838 aa-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B MTQ2Q03920 221 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B PBA1Q05778 276 aa-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B CDA1Q06702 301 aa-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B SSP2Q08646 371 aa-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B SRL1Q08673 210 aa-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B CTF3Q12748 733 aa-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B TPK3P05986 398 aa-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B VAS1P07806 1104 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B MIS1P09440 975 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B MRS3P10566 314 aa-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B DBR1P24309 405 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B KIN82P25341 720 aa-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B YCR100CP25606 316 aa-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B PAH1P32567 862 aa-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B ATO2P32907 282 aa-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B RTC2P38279 296 aa-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B TIF5P38431 405 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B ERP2P39704 215 aa-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B CCM1P48237 864 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B MTQ1P53944 314 aa-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B LCD1Q04377 747 aa-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B REH1Q06709 432 aa-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B CRD1Q07560 283 aa-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B MMT2Q08970 484 aa-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B SSF2Q12153 453 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B YDL012CQ12489 107 aa-0.63□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B CHD1P32657 1468 aa-0.64□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B GAL1P04385 528 aa-0.64□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B FBP1P09201 348 aa-0.64□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B YHR212W-AP0CX91 67 aa-0.64□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B RED1P14291 827 aa-0.64□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B OLE1P21147 510 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B CHA1P25379 360 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B SWI3P32591 825 aa-0.64□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B SGE1P33335 543 aa-0.64□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B SOL2P37262 315 aa-0.64□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B TEL2P53038 688 aa-0.64□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B DCP2P53550 970 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B MSO1P53604 210 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B RIA1P53893 1110 aa-0.64□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B ENT5Q03769 411 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B MSC3Q05812 728 aa-0.64□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B SOG2Q08817 791 aa-0.64□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B RIM20Q12033 661 aa-0.64□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B PST1Q12355 444 aa-0.64□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B NAG1Q8TGN9 163 aa-0.64□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B RAD61Q99359 647 aa-0.64□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B HXK1P04806 485 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B GPA1P08539 472 aa-0.64□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B YLL053CP0CD98 152 aa-0.64□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B MRP2P10663 115 aaPredicted RBP-0.64□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B PMS1P14242 873 aa-0.64□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B CDC34P14682 295 aa-0.64□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B KDX1P36005 433 aa-0.64□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B TRZ1P36159 838 aaPredicted RBP-0.64□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B SHE1P38200 338 aa-0.64□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B PBY1P38254 753 aa-0.64□□□□□ -2.51
YHL009W-BYHL009W-B BAT1P38891 393 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
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