RNA–Protein interactions for RNA: YKL018W

SWD2, Transcript of Subunit of the COMPASS (Set1C) histone H3K4 methyltransferase complex, yeast

Gene SWD2, Length 990 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SWD2	YKL018W	YGR111W	P53265	400 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SWD2	YKL018W	BTN2	P53286	410 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SWD2	YKL018W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
SWD2	YKL018W	HOT1	Q03213	719 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SWD2	YKL018W	VTI1	Q04338	217 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SWD2	YKL018W	DCI1	Q08558	271 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SWD2	YKL018W	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
SWD2	YKL018W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
SWD2	YKL018W	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
SWD2	YKL018W	URA4	P20051	364 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SWD2	YKL018W	BNA4	P38169	460 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SWD2	YKL018W	SLM4	P38247	162 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SWD2	YKL018W	ARP1	P38696	384 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SWD2	YKL018W	UBA4	P38820	440 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SWD2	YKL018W	MBB1	P39534	108 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SWD2	YKL018W	EFM4	P40516	257 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SWD2	YKL018W	FET5	P43561	622 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SWD2	YKL018W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
SWD2	YKL018W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
SWD2	YKL018W	YGL082W	P53155	381 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SWD2	YKL018W	SKO1	Q02100	647 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SWD2	YKL018W	SHR3	Q02774	210 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SWD2	YKL018W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
SWD2	YKL018W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
SWD2	YKL018W	CEX1	Q12453	761 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SWD2	YKL018W	CHD1	P32657	1468 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SWD2	YKL018W	HIP1	P06775	603 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SWD2	YKL018W	RHO2	P06781	192 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SWD2	YKL018W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SWD2	YKL018W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SWD2	YKL018W	PUP2	P32379	260 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SWD2	YKL018W	LTV1	P34078	463 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SWD2	YKL018W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SWD2	YKL018W	MMS4	P38257	691 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SWD2	YKL018W	YHR210C	P38893	341 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SWD2	YKL018W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SWD2	YKL018W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SWD2	YKL018W	COS5	P47187	383 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SWD2	YKL018W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SWD2	YKL018W	NUP100	Q02629	959 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SWD2	YKL018W	TAP42	Q04372	366 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SWD2	YKL018W	COS7	Q07788	383 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SWD2	YKL018W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SWD2	YKL018W	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SWD2	YKL018W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SWD2	YKL018W	PEP5	P12868	1029 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	CLN1	P20437	546 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	SNT1	P25357	1226 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	RAD51	P25454	400 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	PHD1	P36093	366 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	PIM1	P36775	1133 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	YBR139W	P38109	508 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	LAG1	P38703	411 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	YHR218W	P38899	603 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	PHO90	P39535	881 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	PKP2	P53170	491 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	SOL4	P53315	255 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	EOS1	P53938	366 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	ACL4	Q03771	387 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	YMR130W	Q04223	302 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	YDR286C	Q05530	114 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	MMR1	Q06324	491 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	SSK1	Q07084	712 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	PPT2	Q12036	173 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	3.4	□□□□□ -1.87	not detected
SWD2	YKL018W	FRE6	Q12473	712 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	TYR1	P20049	452 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	SWH1	P35845	1188 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	CBP4	P37267	147 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	VHC1	P38329	1120 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	POP1	P41812	875 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	BUD32	P53323	261 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	SLG1	P54867	378 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	YPL014W	Q02606	381 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	YEH2	Q07950	538 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	AEP3	Q12089	606 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	MED2	Q12124	431 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	VAM3	Q12241	283 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	SPO7	P18410	259 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	SNC1	P31109	117 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	REC114	P32841	428 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	MSN2	P33748	704 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	SEC9	P40357	651 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	YJR154W	P47181	346 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	YPL107W	Q02873	248 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	DCS1	Q06151	350 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SWD2	YKL018W	YPR172W	Q06608	200 aa		3.38	□□□□□ -1.87

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 56.2 ms