RNA–Protein interactions for RNA: YGL009C

LEU1, Transcript of Isopropylmalate isomerase, yeast

Gene LEU1, Length 2,340 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LEU1	YGL009C	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	SWC5	P38326	303 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	YBR259W	P38338	688 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	SFB3	P38810	929 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	FMO1	P38866	432 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	MET28	P40573	187 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	INN1	P53901	409 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	MRS2	Q01926	470 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	ARG7	Q04728	441 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	CRF1	Q04930	467 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	NDE2	Q07500	545 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	PNS1	Q12412	539 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	CTF3	Q12748	733 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	RAD9	P14737	1309 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	RAD7	P06779	565 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	RTT107	P38850	1070 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	SSO2	P39926	295 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	PCI8	P40512	444 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	MDV1	P47025	714 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	ZAP1	P47043	880 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	STB4	P50104	949 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	DIA3	P52290	468 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	UAF30	Q08747	228 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	NCB2	Q92317	146 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	USO1	P25386	1790 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	SOD2	P00447	233 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	KIN82	P25341	720 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	ALY1	P36117	915 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	GAB1	P41733	394 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	IBA57	P47158	497 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	GLO1	P50107	326 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	TAM41	P53230	385 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	VPS74	Q06385	345 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	ARO10	Q06408	635 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	TMA16	Q08687	178 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	NUS1	Q12063	375 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	POM34	Q12445	299 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	EDE1	P34216	1381 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	RHB1	P25378	209 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	APT2	P36973	181 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	YHI9	P38765	294 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	SLZ1	P40167	298 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	SAD1	P43589	448 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	JJJ3	P47138	172 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	MND1	P53102	219 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	RTT102	P53330	157 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	RCF2	P53721	224 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	RMI1	Q02685	241 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	INA17	Q02888	182 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	SMA2	Q04658	369 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	STE23	Q06010	1027 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	YPD1	Q07688	167 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	TRE1	Q08919	783 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	AIM41	Q12032	185 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	VAM3	Q12241	283 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	SFG1	Q12507	346 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	RAD50	P12753	1312 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	TUP1	P16649	713 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	PEX3	P28795	441 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	HMT1	P38074	348 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	STB5	P38699	743 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	BUD9	P53226	547 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	COX18	P53239	316 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	KAP120	Q02932	1032 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	USA1	Q03714	838 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	SOV1	Q04748	898 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	WHI2	P12611	486 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	PCT1	P13259	424 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	ADY2	P25613	283 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	SEF1	P34228	1148 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	EHT1	P38295	451 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	MSS4	P38994	779 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	IRC24	P40580	263 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	GTO1	P48239	356 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	YGR126W	P53274	230 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	RRN9	P53437	365 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67

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