RNA–Protein interactions for RNA: YKL206C

ADD66, Transcript of Protein involved in 20S proteasome assembly, yeast

Gene ADD66, Length 804 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ADD66	YKL206C	MRP7	P12687	371 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ADD66	YKL206C	SWE1	P32944	819 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ADD66	YKL206C	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ADD66	YKL206C	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ADD66	YKL206C	YBR225W	P38321	900 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ADD66	YKL206C	YHR210C	P38893	341 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ADD66	YKL206C	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ADD66	YKL206C	TOF2	Q02208	771 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ADD66	YKL206C	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ADD66	YKL206C	DNF3	Q12674	1656 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ADD66	YKL206C	IML1	P47170	1584 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ADD66	YKL206C	PMS1	P14242	873 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ADD66	YKL206C	YME1	P32795	747 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ADD66	YKL206C	ECM15	P35195	104 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ADD66	YKL206C	CSM2	P40465	213 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ADD66	YKL206C	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
ADD66	YKL206C	YJR154W	P47181	346 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ADD66	YKL206C	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ADD66	YKL206C	THI20	Q08224	551 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ADD66	YKL206C	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ADD66	YKL206C	RAV1	P47104	1357 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ADD66	YKL206C	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	SHP1	P34223	423 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	MSR1	P38714	643 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	YER130C	P39959	443 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	YGL260W	P53056	76 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	TIP41	Q12199	356 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	RLM1	Q12224	676 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	SPT7	P35177	1332 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	FOB1	O13329	566 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	GAL80	P04387	435 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	YML002W	P0CF17	737 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	MET8	P15807	274 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	RPN12	P32496	274 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	MFB1	Q04922	465 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	THP1	Q08231	455 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	DAP1	Q12091	152 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	PRD1	P25375	712 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	SRO77	P38163	1010 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	OPY1	P38271	328 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	IKS1	P47042	667 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	RBA50	Q04418	439 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	YOR365C	Q08844	703 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	PLP2	Q12017	286 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	APE1	P14904	514 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	BNA4	P38169	460 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	DOT5	P40553	215 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	BUD32	P53323	261 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	COG4	Q06096	861 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
ADD66	YKL206C	RAD9	P14737	1309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	NUP192	P47054	1683 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	EXO70	P19658	623 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	YCR007C	P25354	239 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	CST26	P38226	397 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	NPR2	P39923	615 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
ADD66	YKL206C	MET28	P40573	187 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	YDR239C	Q03780	787 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	IVY1	Q04934	453 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	COQ9	Q05779	260 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	MRE11	P32829	692 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	PTR2	P32901	601 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	SPO22	P40511	975 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	PET130	P47065	347 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	TIM10	P87108	93 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	SEC39	Q12745	709 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	RTP1	Q12751	981 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	HAP1	P0CE41	1502 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	USO1	P25386	1790 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	KRE5	P22023	1365 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	SPC110	P32380	944 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	NDC1	P32500	655 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	MUM2	P38236	366 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	MDM31	P38880	579 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	PPT2	Q12036	173 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	YDL009C	Q12210	107 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ADD66	YKL206C	CYB2	P00175	591 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ADD66	YKL206C	ARG3	P05150	338 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ADD66	YKL206C	UTR4	P32626	227 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ADD66	YKL206C	DUG2	P38149	878 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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