RNA–Protein interactions for RNA: YOR329C

SCD5, Transcript of Protein required for normal actin organization and endocytosis, yeast

Gene SCD5, Length 2,619 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SCD5	YOR329C	CKB1	P43639	278 aa		3.26	□□□□□ -1.89
SCD5	YOR329C	DIP2	Q12220	943 aa	Predicted RBP	3.26	□□□□□ -1.89
SCD5	YOR329C	BMT6	Q12291	365 aa		3.26	□□□□□ -1.89
SCD5	YOR329C	SPT21	P35209	758 aa		3.24	□□□□□ -1.89
SCD5	YOR329C	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	3.24	□□□□□ -1.89
SCD5	YOR329C	IML1	P47170	1584 aa		3.24	□□□□□ -1.89
SCD5	YOR329C	YOR238W	Q08634	303 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SCD5	YOR329C	VMR1	P38735	1592 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SCD5	YOR329C	BCH2	P36122	765 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SCD5	YOR329C	THI12	P42883	340 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SCD5	YOR329C	THI5	P43534	340 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SCD5	YOR329C	THI11	P47183	340 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SCD5	YOR329C	THI13	Q07748	340 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SCD5	YOR329C	BFR2	Q06631	534 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
SCD5	YOR329C	RAV1	P47104	1357 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SCD5	YOR329C	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
SCD5	YOR329C	TIF11	P38912	153 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SCD5	YOR329C	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SCD5	YOR329C	RTC1	Q08281	1341 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SCD5	YOR329C	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SCD5	YOR329C	RGA1	P39083	1007 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SCD5	YOR329C	YIL055C	P40523	627 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SCD5	YOR329C	WSC3	Q12215	556 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SCD5	YOR329C	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SCD5	YOR329C	ESL2	P36168	1195 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SCD5	YOR329C	BCK1	Q01389	1478 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SCD5	YOR329C	IPL1	P38991	367 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SCD5	YOR329C	YMR074C	Q04773	145 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SCD5	YOR329C	LDB19	Q12502	818 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SCD5	YOR329C	PTP3	P40048	928 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SCD5	YOR329C	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SCD5	YOR329C	MHP1	P43638	1398 aa		3.15	□□□□□ -1.9
SCD5	YOR329C	IOC4	Q04213	475 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SCD5	YOR329C	IOC2	Q12072	812 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SCD5	YOR329C	PDR11	P40550	1411 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SCD5	YOR329C	NSR1	P27476	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.13	□□□□□ -1.91	not detected
SCD5	YOR329C	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SCD5	YOR329C	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SCD5	YOR329C	APP1	P53933	587 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SCD5	YOR329C	YRF1-2	P40105	1681 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SCD5	YOR329C	EDE1	P34216	1381 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SCD5	YOR329C	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SCD5	YOR329C	MRX12	P47084	519 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SCD5	YOR329C	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SCD5	YOR329C	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SCD5	YOR329C	NUP192	P47054	1683 aa		3.09	□□□□□ -1.92
SCD5	YOR329C	SPE2	P21182	396 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SCD5	YOR329C	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SCD5	YOR329C	ULI1	P43604	169 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SCD5	YOR329C	BCK2	P33306	851 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SCD5	YOR329C	BDF1	P35817	686 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SCD5	YOR329C	TAF5	P38129	798 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SCD5	YOR329C	GTT3	P39996	337 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SCD5	YOR329C	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SCD5	YOR329C	PSK1	P31374	1356 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SCD5	YOR329C	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SCD5	YOR329C	PDS5	Q04264	1277 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SCD5	YOR329C	ENV9	Q08651	330 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SCD5	YOR329C	RRP5	Q05022	1729 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SCD5	YOR329C	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SCD5	YOR329C	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SCD5	YOR329C	ENT1	Q12518	454 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SCD5	YOR329C	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SCD5	YOR329C	GRX4	P32642	244 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SCD5	YOR329C	YAP5	P40574	245 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SCD5	YOR329C	TAF8	Q03750	510 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SCD5	YOR329C	EPS1	P40557	701 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SCD5	YOR329C	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
SCD5	YOR329C	TAP42	Q04372	366 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SCD5	YOR329C	UBP1	P25037	809 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SCD5	YOR329C	RAD9	P14737	1309 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SCD5	YOR329C	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
SCD5	YOR329C	RTF1	P53064	558 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SCD5	YOR329C	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
SCD5	YOR329C	MLP1	Q02455	1875 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
SCD5	YOR329C	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
SCD5	YOR329C	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
SCD5	YOR329C	RRD1	P40454	393 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
SCD5	YOR329C	CAB1	Q04430	367 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SCD5	YOR329C	RIA1	P53893	1110 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SCD5	YOR329C	CPS1	P27614	576 aa		3.03	□□□□□ -1.93
SCD5	YOR329C	KRE5	P22023	1365 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SCD5	YOR329C	SPT7	P35177	1332 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SCD5	YOR329C	TFA1	P36100	482 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SCD5	YOR329C	YBL086C	P38177	466 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SCD5	YOR329C	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
SCD5	YOR329C	UGA2	P38067	497 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SCD5	YOR329C	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
SCD5	YOR329C	CDC45	Q08032	650 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SCD5	YOR329C	RTG1	P32607	177 aa		3	□□□□□ -1.93
SCD5	YOR329C	CTF4	Q01454	927 aa		3	□□□□□ -1.93
SCD5	YOR329C	NCR1	Q12200	1170 aa		3	□□□□□ -1.93
SCD5	YOR329C	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
SCD5	YOR329C	YRF1-4	O13559	1382 aa		3	□□□□□ -1.93
SCD5	YOR329C	YML133C	Q03099	1374 aa		3	□□□□□ -1.93
SCD5	YOR329C	YLL067C	Q07888	1374 aa		3	□□□□□ -1.93
SCD5	YOR329C	YLL066C	Q99208	1374 aa		3	□□□□□ -1.93
SCD5	YOR329C	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
SCD5	YOR329C	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
SCD5	YOR329C	RTG3	P38165	486 aa		2.98	□□□□□ -1.93

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