RNA–Protein interactions for RNA: YOR264W

DSE3, Transcript of Daughter cell-specific protein, may help establish daughter fate, yeast

Gene DSE3, Length 1,293 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSE3	YOR264W	MRE11	P32829	692 aa		5.25	□□□□□ -1.57
DSE3	YOR264W	ECM15	P35195	104 aa		5.25	□□□□□ -1.57
DSE3	YOR264W	VID24	P38263	362 aa		5.25	□□□□□ -1.57
DSE3	YOR264W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
DSE3	YOR264W	AIM22	P47051	409 aa		5.25	□□□□□ -1.57
DSE3	YOR264W	YJR154W	P47181	346 aa		5.25	□□□□□ -1.57
DSE3	YOR264W	SRB7	P47822	140 aa		5.25	□□□□□ -1.57
DSE3	YOR264W	PDS5	Q04264	1277 aa		5.25	□□□□□ -1.57
DSE3	YOR264W	RBA50	Q04418	439 aa		5.25	□□□□□ -1.57
DSE3	YOR264W	YEH2	Q07950	538 aa		5.25	□□□□□ -1.57
DSE3	YOR264W	THI20	Q08224	551 aa		5.25	□□□□□ -1.57
DSE3	YOR264W	YOR365C	Q08844	703 aa		5.25	□□□□□ -1.57
DSE3	YOR264W	ATG29	Q12092	213 aa		5.25	□□□□□ -1.57
DSE3	YOR264W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
DSE3	YOR264W	RED1	P14291	827 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DSE3	YOR264W	ELO2	P25358	347 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DSE3	YOR264W	GPI10	P30777	616 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DSE3	YOR264W	RIM2	P38127	377 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DSE3	YOR264W	BNA4	P38169	460 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DSE3	YOR264W	MET18	P40469	1032 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DSE3	YOR264W	STB2	P46679	850 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DSE3	YOR264W	TWF1	P53250	332 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DSE3	YOR264W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
DSE3	YOR264W	TAF11	Q04226	346 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DSE3	YOR264W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
DSE3	YOR264W	SEC39	Q12745	709 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DSE3	YOR264W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DSE3	YOR264W	COR1	P07256	457 aa		5.23	□□□□□ -1.57
DSE3	YOR264W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
DSE3	YOR264W	YTA12	P40341	825 aa		5.23	□□□□□ -1.57
DSE3	YOR264W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
DSE3	YOR264W	NRT1	Q08485	598 aa		5.23	□□□□□ -1.57
DSE3	YOR264W	RAV1	P47104	1357 aa		5.23	□□□□□ -1.57
DSE3	YOR264W	APE1	P14904	514 aa		5.22	□□□□□ -1.57
DSE3	YOR264W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
DSE3	YOR264W	ROX1	P25042	368 aa		5.22	□□□□□ -1.57
DSE3	YOR264W	PPZ1	P26570	692 aa		5.22	□□□□□ -1.57
DSE3	YOR264W	CMC1	P36064	111 aa		5.22	□□□□□ -1.57
DSE3	YOR264W	MUM2	P38236	366 aa		5.22	□□□□□ -1.57
DSE3	YOR264W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
DSE3	YOR264W	SCS3	P53012	380 aa		5.22	□□□□□ -1.57
DSE3	YOR264W	IVY1	Q04934	453 aa		5.22	□□□□□ -1.57
DSE3	YOR264W	YLR287C	Q05881	355 aa		5.22	□□□□□ -1.57
DSE3	YOR264W	CDC23	P16522	626 aa		5.21	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	PMT1	P33775	817 aa		5.21	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	GCS1	P35197	352 aa		5.21	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	YAT2	P40017	923 aa		5.21	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	CSM2	P40465	213 aa		5.21	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.21	□□□□□ -1.58	not detected
DSE3	YOR264W	IKS1	P47042	667 aa		5.21	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	JJJ1	P53863	590 aa		5.21	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	YMR087W	Q04299	284 aa		5.21	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	RTN2	Q12443	393 aa		5.21	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	MBB1	P39534	108 aa		5.2	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	HXT14	P42833	540 aa		5.2	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	MSN2	P33748	704 aa		5.19	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	DUG2	P38149	878 aa		5.19	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	RTT107	P38850	1070 aa		5.19	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	SMF1	P38925	575 aa		5.19	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	VPS52	P39904	641 aa		5.19	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	TIP41	Q12199	356 aa		5.19	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	GRX6	Q12438	231 aa		5.19	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	YCR007C	P25354	239 aa		5.18	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	FRE1	P32791	686 aa		5.18	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	YJL070C	P40361	888 aa		5.18	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	SLD5	Q03406	294 aa		5.18	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	PHO92	Q06390	306 aa		5.18	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	DAP1	Q12091	152 aa		5.18	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	SUC2	P00724	532 aa		5.17	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	PTR2	P32901	601 aa		5.17	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	SEC66	P33754	206 aa		5.17	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	POP1	P41812	875 aa		5.17	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	MEP2	P41948	499 aa		5.17	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	CRZ1	P53968	678 aa		5.17	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	NDD1	Q08887	554 aa		5.17	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	SCM3	Q12334	223 aa		5.17	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	PMS1	P14242	873 aa		5.16	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	ERG3	P32353	365 aa		5.16	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	UTR4	P32626	227 aa		5.16	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	GPI1	P53306	609 aa		5.16	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	YMR317W	Q04893	1140 aa		5.16	□□□□□ -1.58
DSE3	YOR264W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
DSE3	YOR264W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59

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