RNA–Protein interactions for RNA: YLR363C

NMD4, Transcript of Protein that may be involved in nonsense-mediated mRNA decay, yeast

Gene NMD4, Length 657 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NMD4	YLR363C	SPO22	P40511	975 aa		5.01	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	SGF73	P53165	657 aa		5.01	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	YGR021W	P53212	290 aa		5.01	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	YNR061C	P53747	219 aa		5.01	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	PSK2	Q08217	1101 aa		5.01	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	YOR111W	Q99210	232 aa		5.01	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	YOR019W	Q99248	730 aa		5.01	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	BUD2	P33314	1104 aa		5	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	TVP38	P36164	337 aa		5	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	YPK3	P38070	525 aa		5	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	NDT80	P38830	627 aa		5	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	PSD1	P39006	500 aa		5	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	PKP1	P40530	394 aa		5	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	SAD1	P43589	448 aa		5	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	YTP1	P53584	459 aa		5	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	RCO1	Q04779	684 aa		5	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	FMP42	Q04991	504 aa		5	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		5	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	ECM29	P38737	1868 aa		5	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	RPB8	P20436	146 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	SLC1	P33333	303 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	SAS3	P34218	831 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	HXT9	P40885	567 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	IME4	P41833	600 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	SMC3	P47037	1230 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	NNF2	P53253	936 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	NDD1	Q08887	554 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	ARP6	Q12509	438 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	SPC110	P32380	944 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	OPY1	P38271	328 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	YHR131C	P38835	850 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	RTT107	P38850	1070 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	RTS3	P53289	263 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	MUB1	Q03162	620 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	SYN8	P31377	255 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	PDR3	P33200	976 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	EFM2	P38347	419 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	TVP23	P38962	199 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	YND1	P40009	630 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	YER010C	P40011	234 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	IAH1	P41734	238 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	MMR1	Q06324	491 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	NRT1	Q08485	598 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NMD4	YLR363C	MGR1	P25573	417 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	GAC1	P28006	793 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	MRP20	P32387	263 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	RXT2	P38255	430 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	BZZ1	P38822	633 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	EKI1	Q03764	534 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	RSF1	Q05043	376 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	APL4	Q12028	832 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	NBP2	Q12163	236 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	CEX1	Q12453	761 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	HNM1	P19807	563 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	MIA40	P36046	403 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	UIP3	P39547	235 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	SLZ1	P40167	298 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	MAF1	P41910	395 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	YGL138C	P53122	345 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	CSM3	Q04659	317 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	YLR352W	Q06479	807 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	DAP1	Q12091	152 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	ATG9	Q12142	997 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	INP53	Q12271	1107 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	HIF1	Q12373	385 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	PPZ1	P26570	692 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	YKL050C	P35736	922 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	RRN3	P36070	627 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	FUI1	P38196	639 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	AXL2	P38928	823 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	FMP10	P40098	244 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	RTS2	P40962	232 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	RET3	P53600	189 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	INA17	Q02888	182 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	YDL218W	Q07629	317 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	SMC5	Q08204	1093 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	CBF2	P32504	956 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	UBP11	P36026	717 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NMD4	YLR363C	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62

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