RNA–Protein interactions for RNA: YKL163W

PIR3, Transcript of O-glycosylated covalently-bound cell wall protein, yeast

Gene PIR3, Length 978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PIR3	YKL163W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	IME4	P41833	600 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	HXT14	P42833	540 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	BIT61	P47041	543 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	CTR1	P49573	406 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	LCL3	P53153	274 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	GIM3	P53900	129 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	YLR413W	Q06689	675 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	BUD7	Q08754	746 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	VPS54	Q12071	889 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	ACF2	Q12168	779 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	GPR1	Q12361	961 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	ISN1	Q99312	450 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	TOR1	P35169	2470 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	GAL80	P04387	435 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	POX1	P13711	748 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	MRPL25	P23369	157 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	PPS1	P38148	807 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	PEX18	P38855	283 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	NUP60	P39705	539 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	YTA12	P40341	825 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	SCS3	P53012	380 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	CGR1	P53188	120 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	GND2	P53319	492 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	BOP3	P53958	396 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	ATG23	Q06671	453 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	VPS36	Q06696	566 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	FRE5	Q08908	694 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	UBX3	Q12229	455 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	POM34	Q12445	299 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	TRM11	Q12463	433 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	LAM4	P38800	1345 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	DAP2	P18962	818 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	VPS3	P23643	1011 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	VMA16	P23968	213 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	YME2	P32843	850 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	SHP1	P34223	423 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	RPC37	P36121	282 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	RPP1	P38786	293 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	ECM1	P39715	212 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	ASG1	P40467	964 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	FKH2	P41813	862 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	PFA3	P42836	336 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	PET130	P47065	347 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	IRC10	Q08118	586 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	SPE4	Q12455	300 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	AFG1	P32317	509 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	HMX1	P32339	317 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	SRB5	P32585	307 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	MRE11	P32829	692 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	SEC66	P33754	206 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	MRPL4	P36517	319 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	SLM4	P38247	162 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	STB5	P38699	743 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	YJL193W	P39542	402 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	FTR1	P40088	404 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.11	□□□□□ -1.75	not detected
PIR3	YKL163W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	PRM1	P53835	661 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	DLT1	Q04216	342 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	ECM18	Q04623	453 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	ASM4	Q05166	528 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	MSC3	Q05812	728 aa		4.11	□□□□□ -1.75

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