RNA–Protein interactions for RNA: YKL033W

TTI1, Transcript of Subunit of the ASTRA complex, involved in chromatin remodeling, yeast

Gene TTI1, Length 3,117 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TTI1	YKL033W	HEM14	P40012	539 aa		1.32	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	1.32	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	POL31	P46957	487 aa		1.32	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	NPA3	P47122	385 aa		1.32	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	TOF1	P53840	1238 aa		1.32	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	ESBP6	P53918	673 aa		1.32	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	ARK1	P53974	638 aa		1.32	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	NKP2	Q06162	153 aa		1.32	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	YOR387C	Q08910	206 aa		1.32	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	CEX1	Q12453	761 aa		1.32	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	1.32	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	CLN3	P13365	580 aa		1.32	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	1.32	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	YSC83	P32792	385 aa		1.32	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	SWE1	P32944	819 aa		1.32	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	YBR139W	P38109	508 aa		1.32	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	RXT2	P38255	430 aa		1.32	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	ASG7	P46993	209 aa		1.32	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	VEL1	P53058	206 aa		1.32	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	ARP5	P53946	755 aa		1.32	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	MCH4	Q08268	501 aa		1.32	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	TCO89	Q08921	799 aa		1.32	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	FOB1	O13329	566 aa		1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	MSF1	P08425	469 aa		1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	RED1	P14291	827 aa		1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	ALG1	P16661	449 aa		1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	GPI10	P30777	616 aa		1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	PCL6	P40038	420 aa		1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	CUL3	P53202	744 aa		1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	YNL146W	P53906	100 aa		1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	DON1	Q05610	365 aa		1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	BNA5	Q05979	453 aa		1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	FRE3	Q08905	711 aa		1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	PPH22	P23595	377 aa		1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	LAC1	P28496	418 aa		1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	UBX6	P47049	396 aa		1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	UBP8	P50102	471 aa		1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	EMC4	P53073	190 aa		1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	RSC1	P53236	928 aa		1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	IPI3	P53877	555 aa		1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	PRM6	Q04705	352 aa		1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	PSR2	Q07949	397 aa		1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	PEX15	Q08215	383 aa		1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	TRE2	Q08693	809 aa		1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	HSP42	Q12329	375 aa		1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	RKM5	Q12367	367 aa		1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	UBR1	P19812	1950 aa		1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	MRPL37	P36532	105 aa		1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	RKM3	P38222	552 aa		1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	ATG12	P38316	186 aa		1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	BZZ1	P38822	633 aa		1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	CHS6	P40955	746 aa		1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	YGR079W	P53249	370 aa		1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	REG1	Q00816	1014 aa		1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	SND1	Q04007	877 aa		1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	ARP9	Q05123	467 aa		1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	YLR281C	Q05863	155 aa		1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	YLR352W	Q06479	807 aa		1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	POS5	Q06892	414 aa		1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	NUR1	Q12066	484 aa		1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	YRM1	Q12340	786 aa		1.31	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	1.3	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	KAR1	P11927	433 aa		1.3	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	PHO3	P24031	467 aa		1.3	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	YCR006C	P25350	157 aa		1.3	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	PEP3	P27801	918 aa		1.3	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	PFS1	P38872	237 aa		1.3	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	CIS3	P47001	227 aa		1.3	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	RTT102	P53330	157 aa		1.3	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	1.3	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	AQR1	P53943	586 aa		1.3	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	CRZ1	P53968	678 aa		1.3	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	TRS130	Q03660	1102 aa		1.3	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	TRI1	Q05024	226 aa		1.3	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	VID22	Q05934	901 aa		1.3	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	SMC5	Q08204	1093 aa		1.3	□□□□□ -2.2
TTI1	YKL033W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	1.3	□□□□□ -2.2

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