RNA–Protein interactions for RNA: YJL095W

BCK1, Transcript of MAPKKK acting in the protein kinase C signaling pathway, yeast

Gene BCK1, Length 4,437 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BCK1	YJL095W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	COS4	P43542	379 aa		2.6	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	KEL2	P50090	882 aa		2.6	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	YGR015C	P53208	328 aa		2.6	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	TPO2	P53283	614 aa		2.6	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	ARP4	P80428	489 aa		2.6	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	GCN5	Q03330	439 aa		2.6	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	YMR209C	Q03648	457 aa		2.6	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	YLR446W	Q06204	433 aa		2.6	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	YDL114W	Q07530	308 aa		2.6	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	NSE1	Q07913	336 aa		2.6	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	SRO7	Q12038	1033 aa		2.6	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	YLR046C	Q12253	270 aa		2.6	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	SFG1	Q12507	346 aa		2.6	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	YEL077C	Q3E7X8	1277 aa		2.6	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	MDM12	Q92328	271 aa		2.6	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	YLR149C	Q99296	730 aa		2.6	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	PUT2	P07275	575 aa		2.6	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.6	□□□□□ -1.99	not detected
BCK1	YJL095W	VAN1	P23642	535 aa		2.6	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	GEX1	P25596	615 aa		2.6	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	STE5	P32917	917 aa		2.6	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	GLG1	P36143	616 aa		2.6	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	GEX2	P36173	615 aa		2.6	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	KTR7	P40504	517 aa		2.6	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	CAB2	P40506	365 aa		2.6	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	EXG2	P52911	562 aa		2.6	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	YNL115C	P53925	644 aa		2.6	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	RAD33	Q04231	177 aa		2.6	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	YPQ1	Q12010	308 aa		2.6	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	VPS68	Q12016	184 aa		2.6	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	HER1	Q12276	1246 aa		2.6	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	MED11	Q99278	115 aa		2.6	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	REP1	P03871	373 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	TYR1	P20049	452 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	CMK2	P22517	447 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	SPO23	P33757	523 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	MDJ1	P35191	511 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	YHR218W	P38899	603 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.59	□□□□□ -1.99	not detected
BCK1	YJL095W	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	RNH70	P53331	553 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	VAC7	P53950	1165 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	RSM28	Q03430	361 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	YDR278C	Q05612	105 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	YCS4	Q06156	1176 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	PLB3	Q08108	686 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	OSW1	Q08692	278 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	NDD1	Q08887	554 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	YPR202W	Q08993	238 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	YPR089W	O13585	888 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	STE7	P06784	515 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	UGA1	P17649	471 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	PEX34	P25584	144 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	CIN8	P27895	1000 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	LHS1	P36016	881 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	RBG1	P39729	369 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	YJL070C	P40361	888 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	UBP7	P40453	1071 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	FAR7	P43592	221 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	MNT2	P53059	558 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	BET4	Q00618	327 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	YPL107W	Q02873	248 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	YPL113C	Q02961	396 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	PIR1	Q03178	341 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	YEH2	Q07950	538 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	GPB1	Q08886	897 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BCK1	YJL095W	STE2	D6VTK4	431 aa		2.59	□□□□□ -2
BCK1	YJL095W	MOD5	P07884	428 aa		2.59	□□□□□ -2
BCK1	YJL095W	SPE1	P08432	466 aa		2.59	□□□□□ -2
BCK1	YJL095W	SEC12	P11655	471 aa		2.59	□□□□□ -2
BCK1	YJL095W	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2
BCK1	YJL095W	EPT1	P22140	391 aa		2.59	□□□□□ -2
BCK1	YJL095W	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.59	□□□□□ -2	not detected
BCK1	YJL095W	SSO1	P32867	290 aa		2.59	□□□□□ -2
BCK1	YJL095W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2
BCK1	YJL095W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2
BCK1	YJL095W	BAP2	P38084	609 aa		2.59	□□□□□ -2
BCK1	YJL095W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2
BCK1	YJL095W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2
BCK1	YJL095W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2

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