RNA–Protein interactions for RNA: YHR203C

RPS4B, Transcript of Protein component of the small (40S) ribosomal subunit, yeast

Gene RPS4B, Length 786 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS4B	YHR203C	ALG3	P38179	458 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	VHC1	P38329	1120 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	SEO1	P39709	593 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	YJL049W	P47048	450 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	TFB2	Q02939	513 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	ROT1	Q03691	256 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	TRM12	Q04235	462 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	TDA9	Q04545	1251 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	ECI1	Q05871	280 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	ATG23	Q06671	453 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	CSF1	Q12150	2958 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	ATP12	P22135	325 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	ATP11	P32453	318 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	TIP20	P33891	701 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	YKR073C	P36153	106 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	MRPL15	P36523	253 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.07	□□□□□ -1.76	not detected
RPS4B	YHR203C	MMS21	P38632	267 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	MEP1	P40260	492 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	PFA3	P42836	336 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	SPG5	P42933	373 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	PET130	P47065	347 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	YJR030C	P47101	745 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	TRM9	P49957	279 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	COG6	P53959	839 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	TPP1	Q03796	238 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	CDA1	Q06702	301 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	YDR056C	Q12025	205 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	YVC1	Q12324	675 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	SPS1	P08458	490 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	YCR006C	P25350	157 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	BUB3	P26449	341 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	MEI5	P32489	222 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	YKL100C	P34248	587 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	RPC37	P36121	282 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	EHT1	P38295	451 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	HAT2	P39984	401 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	NDC80	P40460	691 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	ELP2	P42935	788 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.06	□□□□□ -1.76	not detected
RPS4B	YHR203C	MPS2	P53159	387 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	RIM8	P53179	542 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	YGR053C	P53234	283 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	ECM9	Q02202	377 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	SML1	Q04964	104 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	IRC13	Q08630	104 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	NUS1	Q12063	375 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	YOL107W	Q12239	342 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	GCN1	P33892	2672 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	CYC7	P00045	113 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	GAL7	P08431	366 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	YML002W	P0CF17	737 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	GPA2	P10823	449 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	PET123	P17558	318 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	URA4	P20051	364 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	SEC62	P21825	274 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	LYP1	P32487	611 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	SRB5	P32585	307 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	YRO2	P38079	344 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	MGS1	P40151	587 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	COS12	P53053	380 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	BOP3	P53958	396 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	SPP2	Q02521	185 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	PEX25	Q02969	394 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	NHP10	Q03435	203 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	TRS23	Q03784	219 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	URH1	Q04179	340 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	GAD1	Q04792	585 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	CDC123	Q05791	360 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	MED7	Q08278	222 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	YOR114W	Q12219	294 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPS4B	YHR203C	PNS1	Q12412	539 aa		4.05	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.6 ms