RNA–Protein interactions for RNA: YFR027W

ECO1, Transcript of Acetyltransferase, yeast

Gene ECO1, Length 846 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ECO1	YFR027W	SGT1	Q08446	395 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	SSP2	Q08646	371 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	MED2	Q12124	431 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	SEM1	O94742	89 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	DOA4	P32571	926 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	ANP1	P32629	500 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	MTC7	P32633	139 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	CYM1	P32898	989 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	PPZ2	P33329	710 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	NIC96	P34077	839 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	TOM20	P35180	183 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	STB6	P36085	766 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	YMC2	P38087	329 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	YBL028C	P38202	106 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	CDS1	P38221	457 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	RFC3	P38629	340 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	GOS1	P38736	223 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	TRM5	P38793	499 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	YEN1	P40028	759 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	MDE1	P47095	244 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	MRK1	P50873	501 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	RMR1	P53060	241 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	NMA2	P53204	395 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	YGR067C	P53243	804 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	SOL4	P53315	255 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	GIM3	P53900	129 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	RMI1	Q02685	241 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	PET117	Q02771	107 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	RRN5	Q02983	363 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	SKY1	Q03656	742 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	URH1	Q04179	340 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	RAD33	Q04231	177 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	SPC2	Q04969	178 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	ARO10	Q06408	635 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	SWA2	Q06677	668 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	YAP7	Q08182	245 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	RCN2	Q12044	265 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	NDJ1	Q12366	352 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	SET6	Q12529	373 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	YPT6	Q99260	215 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	DSF1	P0CX08	502 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	YNR073C	P0CX09	502 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	MRP13	P12686	339 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.37	□□□□□ -1.87	not detected
ECO1	YFR027W	KRE2	P27809	442 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	VAM7	P32912	316 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	TAF14	P35189	244 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	YKL050C	P35736	922 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	HES1	P35843	434 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	YPK3	P38070	525 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	PFF1	P38244	976 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	SBE22	P38814	852 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	3.37	□□□□□ -1.87	not detected
ECO1	YFR027W	PAC2	P39937	518 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	FMP10	P40098	244 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	SNM1	P40993	198 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	COS4	P43542	379 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	NMD5	P46970	1048 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	NIT2	P47016	307 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	COS5	P47187	383 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	NAS6	P50086	228 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	TAF6	P53040	516 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	MND1	P53102	219 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	SPC98	P53540	846 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	RET3	P53600	189 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	COS1	P53822	381 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	MAK10	Q02197	733 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	KAP120	Q02932	1032 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	BNA7	Q04066	261 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	SMP3	Q04174	516 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	SOV1	Q04748	898 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	SPO77	Q06134	477 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	VTA1	Q06263	330 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	YPR091C	Q06833	770 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	RAX1	Q08760	435 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	TAH18	Q12181	623 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	YOR214C	Q12282	236 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	YDR061W	Q12298	539 aa		3.37	□□□□□ -1.87

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