RNA–Protein interactions for RNA: YDL135C

RDI1, Transcript of Rho GDP dissociation inhibitor, yeast

Gene RDI1, Length 609 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RDI1	YDL135C	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RDI1	YDL135C	SCM3	Q12334	223 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RDI1	YDL135C	GRX6	Q12438	231 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RDI1	YDL135C	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	ELO2	P25358	347 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	GPI10	P30777	616 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	NPL6	P32832	435 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	YKL100C	P34248	587 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	PDR11	P40550	1411 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	BOP3	P53958	396 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	COQ9	Q05779	260 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	RIM20	Q12033	661 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	RTN2	Q12443	393 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	PRD1	P25375	712 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	MRE11	P32829	692 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	ROT2	P38138	954 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	CST26	P38226	397 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	VID24	P38263	362 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	PHO90	P39535	881 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	VTC2	P43585	828 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	EKI1	Q03764	534 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	RDR1	Q08904	546 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.07	□□□□□ -1.76	not detected
RDI1	YDL135C	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.07	□□□□□ -1.76	not detected
RDI1	YDL135C	IML1	P47170	1584 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	MGM1	P32266	881 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	MSR1	P38714	643 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	SMF1	P38925	575 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	CIN4	P39110	191 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	SOL4	P53315	255 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	YNL234W	P53857	426 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	ESBP6	P53918	673 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	NUP100	Q02629	959 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	YMR155W	Q03795	547 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	SPC19	Q03954	165 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	MRPL1	Q04599	285 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	PDR3	P33200	976 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	PMT1	P33775	817 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	PCI8	P40512	444 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	YIR016W	P40572	265 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	MDV1	P47025	714 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	TWF1	P53250	332 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	YGR126W	P53274	230 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	DUG3	P53871	357 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	FIN1	Q03898	291 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	ECI1	Q05871	280 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	YDL057W	Q07379	328 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	CDC45	Q08032	650 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	ATG29	Q12092	213 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	GCN2	P15442	1659 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	YME1	P32795	747 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	SNG1	P46950	547 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	AIM22	P47051	409 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	GEP3	Q08622	556 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	SEC39	Q12745	709 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	KRE5	P22023	1365 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	PMS1	P14242	873 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	ASK1	P35734	292 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	CMC1	P36064	111 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	BYE1	P36106	594 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	YPK3	P38070	525 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	PCL6	P40038	420 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	RTS2	P40962	232 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	STB2	P46679	850 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	BUD32	P53323	261 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	YNL181W	P53878	407 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	TOF2	Q02208	771 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	UBX3	Q12229	455 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RDI1	YDL135C	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RDI1	YDL135C	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RDI1	YDL135C	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RDI1	YDL135C	GID7	P25569	745 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RDI1	YDL135C	NFU1	P32860	256 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RDI1	YDL135C	SAS3	P34218	831 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RDI1	YDL135C	RKM3	P38222	552 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RDI1	YDL135C	MUM2	P38236	366 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RDI1	YDL135C	LAG1	P38703	411 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RDI1	YDL135C	SPC97	P38863	823 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RDI1	YDL135C	FET5	P43561	622 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RDI1	YDL135C	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
RDI1	YDL135C	YPL014W	Q02606	381 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RDI1	YDL135C	SMA1	Q02651	245 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RDI1	YDL135C	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.1 ms