RNA–Protein interactions for RNA: YML007W

YAP1, Transcript of Basic leucine zipper (bZIP) transcription factor, yeast

Gene YAP1, Length 1,953 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YAP1	YML007W	CLN2	P20438	545 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	SEC15	P22224	910 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	ATP11	P32453	318 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	HOG1	P32485	435 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	PPG1	P32838	368 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	PTM1	P32857	523 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	ARA1	P38115	344 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	RIM2	P38127	377 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	UME6	P39001	836 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	FAR3	P46671	204 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	CIS3	P47001	227 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	COS12	P53053	380 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	IBD2	P53892	351 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	SLM2	P53955	656 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	GOT1	Q03554	138 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	CSN9	Q03981	162 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	CRN1	Q06440	651 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	VAM6	Q07468	1049 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	ATG34	Q12292	412 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	YDR061W	Q12298	539 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	CWP1	P28319	239 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	ASK1	P35734	292 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	PHO89	P38361	574 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	MET12	P46151	657 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	GCV1	P48015	400 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	MRS2	Q01926	470 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	RMI1	Q02685	241 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	ROT1	Q03691	256 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	YMR155W	Q03795	547 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	DIN7	Q12086	430 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	YDR262W	Q12331	272 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	SKM1	Q12469	655 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	PHO5	P00635	467 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	PTP1	P25044	335 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	NTH1	P32356	751 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	MRE11	P32829	692 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	EMC3	P36039	253 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	YHR112C	P38716	378 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	CEM1	P39525	442 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	YJR030C	P47101	745 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	TAF6	P53040	516 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	HST3	P53687	447 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	YML119W	Q03208	357 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	DIC1	Q06143	298 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	YDR056C	Q12025	205 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	RKM5	Q12367	367 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	RHO2	P06781	192 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	SPS22	P25380	463 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	AAD3	P25612	363 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	BUB3	P26449	341 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	SFC1	P33303	322 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	BEM4	P39011	633 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	PTC2	P39966	464 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	YJL049W	P47048	450 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	HXT16	P47185	567 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	YGR053C	P53234	283 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	GTR2	P53290	341 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	HXT15	P54854	567 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	YML131W	Q03102	365 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	TAF12	Q03761	539 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	SRN2	Q99176	213 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YAP1	YML007W	GAL4	P04386	881 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YAP1	YML007W	PRT1	P06103	763 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YAP1	YML007W	CDC21	P06785	304 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YAP1	YML007W	CMP2	P14747	604 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YAP1	YML007W	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.02	□□□□□ -1.61	not detected
YAP1	YML007W	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YAP1	YML007W	TAF14	P35189	244 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YAP1	YML007W	INM1	P38710	295 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YAP1	YML007W	YER158C	P40095	573 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YAP1	YML007W	COA1	P40452	197 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YAP1	YML007W	MNT3	P40549	630 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YAP1	YML007W	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YAP1	YML007W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YAP1	YML007W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YAP1	YML007W	YLR030W	Q07967	263 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YAP1	YML007W	XYL2	Q07993	356 aa		5.02	□□□□□ -1.61

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