RNA–Protein interactions for RNA: YDR107C

TMN2, Transcript of Protein with a role in cellular adhesion and filamentous growth, yeast

Gene TMN2, Length 2,019 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TMN2	YDR107C	ACL4	Q03771	387 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	PDS5	Q04264	1277 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	YDL073W	Q07454	984 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	INP53	Q12271	1107 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	MDY2	Q12285	212 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	MTG2	P38860	518 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	UIP3	P39547	235 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	SIL1	Q08199	421 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	FRE3	Q08905	711 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	VPS54	Q12071	889 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	LAM4	P38800	1345 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	PAN1	P32521	1480 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	PET111	P08468	800 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	ABF1	P14164	731 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	APL3	P38065	1025 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	CHS6	P40955	746 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	COQ9	Q05779	260 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	DFG16	Q99234	619 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	IMG1	P25626	169 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	YIM1	P28625	365 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	NIP100	P33420	868 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	LOT5	P34234	306 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	NUP133	P36161	1157 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	PIM1	P36775	1133 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	VPS41	P38959	992 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	PHM8	P40025	321 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	STU2	P46675	888 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	ALF1	P53904	254 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	MSC1	Q03104	513 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	YMR160W	Q03823	816 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	MGR3	Q04472	501 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	UBX3	Q12229	455 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	HER1	Q12276	1246 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	AFG1	P32317	509 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.72	□□□□□ -1.65	RIP-Chip
TMN2	YDR107C	YME1	P32795	747 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	PXL1	P36166	706 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	MLH1	P38920	769 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	FAR3	P46671	204 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	YGR149W	P48236	432 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	PPM1	Q04081	328 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	RAD33	Q04231	177 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	PHO92	Q06390	306 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	PCL8	Q08966	492 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	TGS1	Q12052	315 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TMN2	YDR107C	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.71	□□□□□ -1.66	not detected
TMN2	YDR107C	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
TMN2	YDR107C	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
TMN2	YDR107C	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
TMN2	YDR107C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
TMN2	YDR107C	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
TMN2	YDR107C	MSR1	P38714	643 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TMN2	YDR107C	OPT1	P40897	799 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TMN2	YDR107C	YJL132W	P47014	750 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TMN2	YDR107C	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
TMN2	YDR107C	CRT10	Q08226	957 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TMN2	YDR107C	SNT2	P53127	1403 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TMN2	YDR107C	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
TMN2	YDR107C	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
TMN2	YDR107C	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
TMN2	YDR107C	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
TMN2	YDR107C	WSS1	P38838	269 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TMN2	YDR107C	GIP4	P39732	760 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TMN2	YDR107C	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
TMN2	YDR107C	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
TMN2	YDR107C	SKO1	Q02100	647 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TMN2	YDR107C	HRD3	Q05787	833 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TMN2	YDR107C	DNF1	P32660	1571 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TMN2	YDR107C	IRC20	Q06554	1556 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TMN2	YDR107C	ERG4	P25340	473 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TMN2	YDR107C	GSH1	P32477	678 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TMN2	YDR107C	LHS1	P36016	881 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TMN2	YDR107C	PFF1	P38244	976 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TMN2	YDR107C	YJL107C	P42947	387 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TMN2	YDR107C	COS5	P47187	383 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TMN2	YDR107C	YGL138C	P53122	345 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TMN2	YDR107C	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
TMN2	YDR107C	ATG4	P53867	494 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TMN2	YDR107C	PLM2	Q04383	521 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TMN2	YDR107C	COS7	Q07788	383 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TMN2	YDR107C	CEX1	Q12453	761 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TMN2	YDR107C	OM45	P16547	393 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TMN2	YDR107C	SPO7	P18410	259 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TMN2	YDR107C	URA4	P20051	364 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TMN2	YDR107C	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66

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