RNA–Protein interactions for RNA: HRA1

HRA1, Non-protein-coding RNA, yeast

Gene HRA1, Length 564 nt, Biotype ncRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HRA1	HRA1	YFR020W	P43600	232 aa		7.65	□□□□□ -1.18
HRA1	HRA1	IBA57	P47158	497 aa		7.65	□□□□□ -1.18
HRA1	HRA1	COS12	P53053	380 aa		7.65	□□□□□ -1.18
HRA1	HRA1	GTR1	Q00582	310 aa		7.65	□□□□□ -1.18
HRA1	HRA1	TPP1	Q03796	238 aa		7.65	□□□□□ -1.18
HRA1	HRA1	URH1	Q04179	340 aa		7.65	□□□□□ -1.18
HRA1	HRA1	DFG5	Q05031	458 aa		7.65	□□□□□ -1.18
HRA1	HRA1	ECI1	Q05871	280 aa		7.65	□□□□□ -1.18
HRA1	HRA1	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	7.65	□□□□□ -1.18
HRA1	HRA1	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	7.65	□□□□□ -1.18
HRA1	HRA1	YLR111W	Q12528	110 aa		7.65	□□□□□ -1.18
HRA1	HRA1	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	7.64	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	7.64	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	ARG1	P22768	420 aa		7.64	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	TSR4	P25040	408 aa		7.64	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	ADH7	P25377	361 aa		7.64	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	GID7	P25569	745 aa		7.64	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	YCL068C	P25593	260 aa		7.64	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	YCR099C	P25657	155 aa		7.64	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	SMI1	P32566	505 aa		7.64	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	SFA1	P32771	386 aa		7.64	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	LST4	P34239	828 aa		7.64	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	TOM20	P35180	183 aa		7.64	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	RCK2	P38623	610 aa		7.64	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	YMR134W	P40207	237 aa		7.64	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	ARH1	P48360	493 aa		7.64	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	SED5	Q01590	340 aa		7.64	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	GIC2	Q06648	383 aa		7.64	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	NCA2	Q12374	616 aa		7.64	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	STT4	P37297	1900 aa		7.63	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	7.63	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		7.63	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	7.63	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	7.63	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	END3	P39013	349 aa		7.63	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	7.63	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	SER3	P40054	469 aa		7.63	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	YIL001W	P40560	513 aa		7.63	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	GCV1	P48015	400 aa		7.63	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	7.63	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	FHN1	P53279	174 aa		7.63	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	7.63	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	TFB2	Q02939	513 aa		7.63	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	SPO19	Q03029	223 aa		7.63	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	NHX1	Q04121	633 aa		7.63	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	REH1	Q06709	432 aa		7.63	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	YDR056C	Q12025	205 aa		7.63	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	HUA2	Q12134	243 aa		7.63	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	HAL9	Q12180	1030 aa		7.63	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	YOR114W	Q12219	294 aa		7.63	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	7.62	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	7.62	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	CLB4	P24871	460 aa		7.62	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	YCL042W	P25572	119 aa		7.62	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	7.62	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	NAM9	P27929	486 aa		7.62	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	SRB5	P32585	307 aa		7.62	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	RPC37	P36121	282 aa		7.62	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	HSE1	P38753	452 aa		7.62	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	7.62	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.62	□□□□□ -1.19	not detected
HRA1	HRA1	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	7.62	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	MBP1	P39678	833 aa		7.62	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	SCC4	P40090	624 aa		7.62	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	7.62	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	MDJ2	P42834	146 aa		7.62	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	7.62	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	7.62	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	7.62	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	FRA1	Q07825	749 aa		7.62	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	7.62	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	RAX1	Q08760	435 aa		7.62	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	RMD5	Q12508	421 aa		7.62	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	COX1	P00401	534 aa		7.61	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	RAD51	P25454	400 aa		7.61	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	YME2	P32843	850 aa		7.61	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	MIA40	P36046	403 aa		7.61	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	GID8	P40208	455 aa		7.61	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	PHB1	P40961	287 aa		7.61	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	HDA3	Q06623	655 aa		7.61	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	SLD7	Q08457	257 aa		7.61	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	IMA3	P0CW40	589 aa		7.6	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	IMA4	P0CW41	589 aa		7.6	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	YAR066W	P0CX18	203 aa		7.6	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	YHR214W	P0CX19	203 aa		7.6	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	KAP122	P32767	1081 aa		7.6	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	ORC2	P32833	620 aa		7.6	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	MOH1	P38191	138 aa		7.6	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	MNL1	P38888	796 aa		7.6	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	RGA1	P39083	1007 aa		7.6	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	MEF2	P39677	819 aa		7.6	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	RTA1	P53047	317 aa		7.6	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
HRA1	HRA1	MPS2	P53159	387 aa		7.6	□□□□□ -1.19

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