RNA–Protein interactions for RNA: YOL022C

TSR4, Cytoplasmic protein required for correct processing of 20S pre-rRNA, yeast

Gene TSR4, Length 1,227 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TSR4	YOL022C	IZH1	Q03419	316 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	POS5	Q06892	414 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	ATG9	Q12142	997 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	CHO1	P08456	276 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	VMA16	P23968	213 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	STE50	P25344	346 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	BYE1	P36106	594 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	EFM2	P38347	419 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	UIP3	P39547	235 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	PKP1	P40530	394 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.38	□□□□□ -1.87	not detected
TSR4	YOL022C	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	JJJ1	P53863	590 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	YMR155W	Q03795	547 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	GRX6	Q12438	231 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	RTN2	Q12443	393 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.37	□□□□□ -1.87	not detected
TSR4	YOL022C	ADH7	P25377	361 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	RPC53	P25441	422 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	MET18	P40469	1032 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	AXL1	P40851	1208 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	DIA3	P52290	468 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	YGR066C	P53242	292 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	ESBP6	P53918	673 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	MAK10	Q02197	733 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	YLR281C	Q05863	155 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	ECI1	Q05871	280 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	GRS2	Q06817	618 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	YOL159C	Q08300	171 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	YLR049C	Q12110	428 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	INP53	Q12271	1107 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	SFI1	Q12369	946 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	HOM3	P10869	527 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	AFG3	P39925	761 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	VID30	P53076	958 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	EFM6	P53970	246 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	VPS38	Q05919	439 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	NRT1	Q08485	598 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	PDX1	P16451	410 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	GPI10	P30777	616 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	SYN8	P31377	255 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	YBR144C	P34215	104 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	UBP11	P36026	717 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	VID24	P38263	362 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	SMF1	P38925	575 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	ELO1	P39540	310 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	DOT5	P40553	215 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	RSC1	P53236	928 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	RTT109	Q07794	436 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	RIM20	Q12033	661 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	AVL9	Q12500	764 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	GAL80	P04387	435 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	MRP13	P12686	339 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	CDC23	P16522	626 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	YKL050C	P35736	922 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	CST26	P38226	397 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	MUM2	P38236	366 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	SMC3	P47037	1230 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	MDG1	P53885	366 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	ZDS2	P54786	942 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	PFA5	Q03289	374 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	YDR131C	Q03899	556 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	YMR254C	Q04838	102 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	CBP1	P07252	654 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TSR4	YOL022C	RAP1	P11938	827 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TSR4	YOL022C	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
TSR4	YOL022C	MRE11	P32829	692 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TSR4	YOL022C	SEF1	P34228	1148 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TSR4	YOL022C	TSC10	P38342	320 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TSR4	YOL022C	RTT107	P38850	1070 aa		3.33	□□□□□ -1.88

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