RNA–Protein interactions for RNA: YDR247W

VHS1, Transcript of Cytoplasmic serine/threonine protein kinase, yeastyeast

Gene VHS1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1YDR247W IST3P40565 148 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W INA22P40576 216 aa5.6□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W YFL064CP43540 174 aa5.6□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W BRO1P48582 844 aa5.6□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W NBP1P52919 319 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W NMA2P53204 395 aa5.6□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W CSL4P53859 292 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W JJJ1P53863 590 aa5.6□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W YNL144CP53907 740 aa5.6□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W DAK1P54838 584 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W AIM33Q04516 312 aa5.6□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W CRF1Q04930 467 aa5.6□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W VAM6Q07468 1049 aa5.6□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W KEL3Q08979 651 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W YBL111CQ3E7Y5 667 aa5.6□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W YLR302CO13544 120 aa5.59□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W RAD51P25454 400 aa5.59□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W YKL023WP36103 277 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W SDH8P38345 138 aa5.59□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W TIF5P38431 405 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W KSP1P38691 1029 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W PIH1P38768 344 aa5.59□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W GAA1P39012 614 aa5.59□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W ARG2P40360 574 aa5.59□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W ESL1P40456 1118 aa5.59□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W AXL1P40851 1208 aa5.59□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W SRB7P47822 140 aa5.59□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W UPF3P48412 387 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W TAM41P53230 385 aa5.59□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W NNF2P53253 936 aa5.59□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W SNF12P53628 566 aa5.59□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W BET4Q00618 327 aa5.59□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W GIR2Q03768 265 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W GSF2Q04697 403 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W YLR297WQ05899 129 aa5.59□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W VIP1Q06685 1146 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W YDL057WQ07379 328 aa5.59□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W NBP2Q12163 236 aa5.59□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W SEM1O94742 89 aa5.58□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W ATP2P00830 511 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W CDC31P06704 161 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W TY2A-LR1P0C2J4 438 aa5.58□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W YMR085WP0CF18 432 aa5.58□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W TY2A-FP0CX61 438 aa5.58□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W TY2A-GR2P0CX62 438 aa5.58□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W PEP5P12868 1029 aa5.58□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W TY2A-CP25383 438 aa5.58□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W TFC3P34111 1160 aa5.58□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W CCL1P37366 393 aa5.58□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W RRT2P38332 387 aa5.58□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W CBR1P38626 284 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W MMS21P38632 267 aa5.58□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W LNP1P38878 278 aa5.58□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W YIP4P53093 235 aa5.58□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W BSC5P53755 489 aa5.58□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W YNL040WP53960 456 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W TY2A-DR2Q03483 438 aa5.58□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W YDR278CQ05612 105 aa5.58□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W BUG1Q12191 341 aa5.58□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W TY2A-BQ12260 438 aa5.58□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W TY2A-OR2Q12293 438 aa5.58□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W HIF1Q12373 385 aa5.58□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W TY2A-DR1Q12392 438 aa5.58□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W TY2A-OR1Q12439 438 aa5.58□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W TY2A-DR3Q99303 438 aa5.58□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W CLN3P13365 580 aa5.57□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W SPO16P17122 198 aa5.57□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W PWP1P21304 576 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W GPI10P30777 616 aa5.57□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W SSE1P32589 693 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W RPC37P36121 282 aa5.57□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W HIS2P38635 335 aa5.57□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W PCL5P38794 229 aa5.57□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W YJR061WP40355 935 aa5.57□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W RPN11P43588 306 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W BUD17P53727 317 aa5.57□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W PGA2P53903 129 aa5.57□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W SMX3P54999 86 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W MTG1Q03151 367 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W ABP140Q08641 628 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W GPN2Q08726 347 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W SKM1Q12469 655 aa5.57□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W PNO1Q99216 274 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W FKS1P38631 1876 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W ILV1P00927 576 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W REC107P21651 314 aa5.56□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W CNE1P27825 502 aa5.56□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W EFB1P32471 206 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W LOT5P34234 306 aa5.56□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W YIL161WP40449 235 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W PXR1P53335 271 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W ESBP6P53918 673 aa5.56□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W SHR3Q02774 210 aa5.56□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W YKU80Q04437 629 aa5.56□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W FUS2Q05670 677 aa5.56□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W TGS1Q12052 315 aa5.56□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W OCA6Q12454 224 aa5.56□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W ILV2P07342 687 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W CBF1P17106 351 aa5.55□□□□□ -1.52
VHS1YDR247W PDE1P22434 369 aa5.55□□□□□ -1.52
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