RNA–Protein interactions for RNA: YBR215W

HPC2, Transcript of Subunit of the HIR complex, yeast

Gene HPC2, Length 1,878 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HPC2	YBR215W	CDC73	Q06697	393 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	VAM3	Q12241	283 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	CBP1	P07252	654 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	CHS1	P08004	1131 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	SNT1	P25357	1226 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	CIN8	P27895	1000 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	ALY1	P36117	915 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	AME1	P38313	324 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	SWC5	P38326	303 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	RRT2	P38332	387 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	YHL012W	P38709	493 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	SAK1	P38990	1142 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	JLP2	P40206	208 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	JJJ2	P46997	583 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	RPA14	P50106	137 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.81	□□□□□ -1.64	not detected
HPC2	YBR215W	ORC4	P54791	529 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	RSM24	Q03976	319 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	SMA2	Q04658	369 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	YDR222W	Q04925	415 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	PIB1	Q06651	286 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	ATG23	Q06671	453 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	RTT109	Q07794	436 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	MET7	Q08645	548 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	YDR061W	Q12298	539 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	ATG31	Q12421	196 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	MSF1	P08425	469 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	DBF2	P22204	572 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	VPS34	P22543	875 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	PBN1	P25580	416 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	NDI1	P32340	513 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	MRP20	P32387	263 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	RPD3	P32561	433 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	AIM29	P36154	155 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	MRPL36	P36531	177 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	FES1	P38260	290 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	VID24	P38263	362 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	SFB3	P38810	929 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	SOK1	P40317	901 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	QDR2	P40474	542 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	YJR124C	P47159	448 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	YGR042W	P53227	271 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	USA1	Q03714	838 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	PPN1	Q04119	674 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	YML082W	Q04533	649 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	STE23	Q06010	1027 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	YLR040C	Q07988	224 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	BSC6	Q08280	497 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	MUM3	Q08750	479 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	WSC3	Q12215	556 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	SFG1	Q12507	346 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	not detected
HPC2	YBR215W	AI1	P03875	834 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	RPP1B	P10622	106 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	CDC26	P14724	124 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	PER1	P25625	357 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	RAD14	P28519	371 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	MRPL4	P36517	319 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	YBL029W	P38201	376 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	RCY1	P39531	840 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	YAP5	P40574	245 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	RTS2	P40962	232 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	TOS3	P43637	560 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	PEF1	P53238	335 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	NMA111	P53920	997 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	PEX12	Q04370	399 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	YDR262W	Q12331	272 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	PTC5	Q12511	572 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	COQ1	P18900	473 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	ZRC1	P20107	442 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HPC2	YBR215W	LDH1	P38139	375 aa		4.79	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.9 ms