RNA–Protein interactions for RNA: YOL093W

TRM10, Transcript of tRNA methyltransferase, yeast

Gene TRM10, Length 882 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRM10	YOL093W	TRS85	P46944	698 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	PIR3	Q03180	325 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	INP2	Q03824	705 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	RXT3	Q07458	294 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	ADY3	Q07732	790 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	YLR012C	Q07927	99 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
TRM10	YOL093W	LDB17	Q12342	491 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	APE1	P14904	514 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	MIH1	P23748	554 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	YCL068C	P25593	260 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	SMI1	P32566	505 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	SIF2	P38262	535 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	SPC97	P38863	823 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	YAT2	P40017	923 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	ATM1	P40416	690 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	PHO23	P50947	330 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	YTP1	P53584	459 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	YNL144C	P53907	740 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	CDC14	Q00684	551 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	SLT2	Q00772	484 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	MRS2	Q01926	470 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	VPS16	Q03308	798 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	YMR160W	Q03823	816 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	FAR8	Q05040	523 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
TRM10	YOL093W	YPQ1	Q12010	308 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	YPL066W	Q12194	479 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	CBF1	P17106	351 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	AGP1	P25376	633 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	MRE11	P32829	692 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	LST4	P34239	828 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	CAB3	P36076	571 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	ALY2	P47029	1046 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	COQ6	P53318	479 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	RCF2	P53721	224 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	YNL058C	P53947	316 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	PET117	Q02771	107 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	YML119W	Q03208	357 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	SEG1	Q04279	960 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	YDR109C	Q04585	715 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	BSP1	Q06604	576 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	SWC7	Q06707	132 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	GPB1	Q08886	897 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	TGL5	Q12043	749 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	LCB4	Q12246	624 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	NCA2	Q12374	616 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	DAL81	P21657	970 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	YSP3	P25036	478 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	TSR4	P25040	408 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	GID7	P25569	745 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	EMC1	P25574	760 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	YCR051W	P25631	222 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	COY1	P34237	679 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	CTF13	P35203	478 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	MRP21	P38175	177 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	VPS41	P38959	992 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	SNG1	P46950	547 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	PLB2	Q03674	706 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	YMR206W	Q03695	313 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	USA1	Q03714	838 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	NHX1	Q04121	633 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	TAF11	Q04226	346 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	CDC123	Q05791	360 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	KCS1	Q12494	1050 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	SEM1	O94742	89 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	ATP12	P22135	325 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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