RNA–Protein interactions for RNA: YMR038C

CCS1, Transcript of Copper chaperone for superoxide dismutase Sod1p, yeast

Gene CCS1, Length 750 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CCS1	YMR038C	DSS4	P32601	143 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	UBS1	P38290	277 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	UME6	P39001	836 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	FHL1	P39521	936 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	CDC1	P40986	491 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	ASG7	P46993	209 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	CPR7	P47103	393 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	YJR054W	P47114	497 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	RFX1	P48743	811 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	GND2	P53319	492 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	COG6	P53959	839 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	TIM44	Q01852	431 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	YLR456W	Q06199	204 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	DDC1	Q08949	612 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	REV1	P12689	985 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	ATP12	P22135	325 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	PRP28	P23394	588 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	PSO2	P30620	661 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	MTH1	P35198	433 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	DUN1	P39009	513 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	HEM14	P40012	539 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	PIG2	P40187	538 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	YIL077C	P40508	320 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	GUF1	P46943	645 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	NUP84	P52891	726 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	YFT2	Q06676	274 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	TRE2	Q08693	809 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
CCS1	YMR038C	RMP1	Q12530	201 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	COX3	P00420	269 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	OM45	P16547	393 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	RML2	P32611	393 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	SET3	P36124	751 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	COS111	P38308	924 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	LTP1	P40347	161 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	UBP7	P40453	1071 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	UFE1	P41834	346 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	PXA1	P41909	870 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	PPM1	Q04081	328 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	USV1	Q12132	391 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	NBP2	Q12163	236 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	AEP2	P22136	580 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	BRF1	P29056	596 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	PRE4	P30657	266 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	HXT4	P32467	576 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	SGE1	P33335	543 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	MIC60	P36112	540 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	NDC80	P40460	691 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	MPS3	P47069	682 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	TAF4	P50105	388 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	VEL1	P53058	206 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	HRD3	Q05787	833 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	UTP20	P35194	2493 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	STE4	P18851	423 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	not detected
CCS1	YMR038C	DAL2	P25335	343 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	MRC1	P25588	1096 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	MTC7	P32633	139 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	COQ5	P49017	307 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	FLC3	P53121	802 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	ATG4	P53867	494 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	YNL144C	P53907	740 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	YPL014W	Q02606	381 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	PIR3	Q03180	325 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	AFT2	Q08957	416 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	VPS54	Q12071	889 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	LCB4	Q12246	624 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	SUL2	Q12325	893 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	SEC15	P22224	910 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCS1	YMR038C	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CCS1	YMR038C	CTP1	P38152	299 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCS1	YMR038C	CDS1	P38221	457 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCS1	YMR038C	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CCS1	YMR038C	ERV46	P39727	415 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCS1	YMR038C	KHA1	P40309	873 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCS1	YMR038C	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CCS1	YMR038C	DSN1	P40568	576 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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