RNA–Protein interactions for RNA: YHL036W

MUP3, Transcript of Low affinity methionine permease, yeast

Gene MUP3, Length 1,641 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MUP3	YHL036W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	GAL80	P04387	435 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
MUP3	YHL036W	SMF1	P38925	575 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	UIP3	P39547	235 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	LTP1	P40347	161 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	CIN1	P40987	1014 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	VPS38	Q05919	439 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	BI2	P03873	423 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	MRP13	P12686	339 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	ADH7	P25377	361 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	UBP11	P36026	717 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	ELO1	P39540	310 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	TAX4	P47030	604 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	EFM6	P53970	246 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	PFA5	Q03289	374 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	YDR131C	Q03899	556 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	RIM20	Q12033	661 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	RLM1	Q12224	676 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	SFI1	Q12369	946 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	YLR111W	Q12528	110 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	SCC2	Q04002	1493 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	GPA1	P08539	472 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	PDX1	P16451	410 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	SAS3	P34218	831 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	PET130	P47065	347 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	IPI3	P53877	555 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	YLR455W	Q06188	304 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	YCR006C	P25350	157 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	SEF1	P34228	1148 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	PXL1	P36166	706 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	VID24	P38263	362 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	STU2	P46675	888 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	VID30	P53076	958 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	NNF2	P53253	936 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	YTP1	P53584	459 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	ZDS2	P54786	942 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	YDR239C	Q03780	787 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	BSP1	Q06604	576 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	AVL9	Q12500	764 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	YNL058C	P53947	316 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	GRC3	Q07845	632 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	RAP1	P11938	827 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	IMG1	P25626	169 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	YBR144C	P34215	104 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	YKL050C	P35736	922 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	HOT13	P36078	116 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	FLO10	P36170	1169 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	CST26	P38226	397 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	ANS1	P38832	159 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	TEN1	Q07921	160 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	ATG29	Q12092	213 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	YLR049C	Q12110	428 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	BNR1	P40450	1375 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MUP3	YHL036W	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	RPO31	P04051	1460 aa		4.84	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	STE50	P25344	346 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	PPZ2	P33329	710 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	TSC10	P38342	320 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	ALG5	P40350	334 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	YLR345W	Q06137	509 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	PDR8	Q06149	701 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	FRE7	Q12333	620 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	CDC25	P04821	1589 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	MSS51	P32335	436 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	PMT1	P33775	817 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	NUP133	P36161	1157 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	MUM2	P38236	366 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	ARP1	P38696	384 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	ORC5	P50874	479 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	MSC1	Q03104	513 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	TPO3	Q06451	622 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	PFA4	Q12006	378 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	SMC6	Q12749	1114 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	ADK2	P26364	225 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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