RNA–Protein interactions for RNA: YHL030W

ECM29, Transcript of Scaffold protein, yeast

Gene ECM29, Length 5,607 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ECM29	YHL030W	TY2B-B	Q12491	1770 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	CMK2	P22517	447 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	ESS1	P22696	170 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	DPH2	P32461	534 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	TOD6	P34219	525 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	BCH2	P36122	765 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	SBE22	P38814	852 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	SER33	P40510	469 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	SYG1	P40528	902 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	UFE1	P41834	346 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	FIG4	P42837	879 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	ORC5	P50874	479 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	BOL2	P53082	120 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	SLD3	P53135	668 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	YNL146W	P53906	100 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	SFM1	Q12314	213 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	ECM3	Q99252	613 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	PEP5	P12868	1029 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	PPH22	P23595	377 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	SGF29	P25554	259 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	ARE1	P25628	610 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	ERG9	P29704	444 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	LDH1	P38139	375 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	RCY1	P39531	840 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	TGL3	P40308	642 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	SNF12	P53628	566 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	FYV6	P53913	173 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	SPO71	Q03868	1245 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	SPH1	Q06160	661 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	MLC2	Q06580	163 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	YOR238W	Q08634	303 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.73	□□□□□ -1.97	not detected
ECM29	YHL030W	FLC1	Q08967	793 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	GET4	Q12125	312 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	ERR1	P0CX10	437 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	ERR2	P0CX11	437 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	MAS1	P10507	462 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	MAS2	P11914	482 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	KAR1	P11927	433 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	PMA2	P19657	947 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	HYM1	P32464	399 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	SKN1	P33336	771 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	NAT2	P37293	288 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	MGE1	P38523	228 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	LNP1	P38878	278 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	VMA7	P39111	118 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	IMA5	P40884	581 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	ERR3	P42222	437 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	GYP8	P43570	497 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	GCV1	P48015	400 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	SDT1	P53078	280 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	YNR068C	P53754	272 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	MAK3	Q03503	176 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	RSN1	Q03516	953 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	YDR514C	Q04408	483 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	YMR074C	Q04773	145 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	RCO1	Q04779	684 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	VID22	Q05934	901 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	IES4	Q08561	116 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	TFB4	Q12004	338 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	MDM32	Q12171	622 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	RDI1	Q12434	202 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	ZPS1	Q12512	249 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	PUT4	P15380	627 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	UTR4	P32626	227 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.73	□□□□□ -1.97	not detected
ECM29	YHL030W	SPL2	P38839	148 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	XDJ1	P39102	459 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	MIT1	P40002	666 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	SER2	P42941	309 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	NMA2	P53204	395 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	TIM13	P53299	105 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	GGA1	Q06336	557 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	VAM6	Q07468	1049 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	YOL131W	Q08270	108 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	CIR2	Q08822	631 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	ATG31	Q12421	196 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	MTR10	Q99189	972 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	PET127	P32606	800 aa		2.72	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	PTC1	P35182	281 aa		2.72	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	CHS6	P40955	746 aa		2.72	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	GCD10	P41814	478 aa		2.72	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97

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